Top Banner
Cinética Enzimática Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich
45

Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Apr 17, 2015

Download

Documents

Internet User
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Page 1: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Cinética EnzimáticaCinética Enzimática

Prof. Dr. Henning Ulrich

Page 2: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.
Page 3: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.
Page 4: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.
Page 5: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência do SubstratoInfluência do Substrato

Concentração de substrato [S]: afeta a Concentração de substrato [S]: afeta a velocidade da reação;velocidade da reação;

Efeito de [S]: varia durante o curso de uma Efeito de [S]: varia durante o curso de uma reação reação SS PP;;

Velocidade inicial (Velocidade inicial (VV00): [S] >> [E] ): [S] >> [E] tempo tempo

muito curto muito curto [S] = constante. [S] = constante.

Page 6: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência do SubstratoInfluência do Substrato

[E] = cte

[S] = V0 linear

[S] = V0

V0 = Vmáx

Page 7: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência do SubstratoInfluência do Substrato

Alguns casos a Alguns casos a VV00 não pode ser medida não pode ser medida• Não existe técnica experimental;Não existe técnica experimental;• Equação química não representa a Equação química não representa a

transformação;transformação;

Velocidade da reação:Velocidade da reação:• Velocidade média de consumo ou Velocidade média de consumo ou

produção;produção;• Variação de uma propriedade no sistema.Variação de uma propriedade no sistema.

Page 8: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência do SubstratoInfluência do Substrato

Vitor Henri (1903): Vitor Henri (1903): EE liga-se ao liga-se ao SS para formar para formar ES ES passo obrigatório; passo obrigatório;

Leonor Michaelis e Maud Menten (1913)Leonor Michaelis e Maud Menten (1913)• EE combina-se reversivelmente com combina-se reversivelmente com SS ESES

kk11

E + S ES E + S ES kk-1-1

• ES se rompe ES se rompe E E ee P P kk22

ES E + PES E + P

Page 9: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência do SubstratoInfluência do Substrato

Qualquer instante da reação: Qualquer instante da reação: E E e e ESES;;

[S] [S] = velocidade da reação = velocidade da reação [S]; [S];

VVmáxmáx = todas as moléculas de = todas as moléculas de EE estiverem estiverem na forma na forma ESES enzima “saturada”; enzima “saturada”;

[S]: estado pré-estacionário [S]: estado pré-estacionário ESES;;• Estado estacionário Estado estacionário [ES] = cte; [ES] = cte;• VV00 estado estacionário. estado estacionário.

Page 10: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Equação Michaelis-Equação Michaelis-MentenMenten

Curva: possui a Curva: possui a mesma forma para a mesma forma para a maioria das enzimas;maioria das enzimas;

Expressa pela Expressa pela Equação de Equação de Michaelis e Menten;Michaelis e Menten;

Hipótese: limitante quebra de ES E + P.

Page 11: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Equação Michaelis-Equação Michaelis-MentenMenten Equação da velocidade para uma reação Equação da velocidade para uma reação

catalisada enzimaticamente e com um único catalisada enzimaticamente e com um único substrato;substrato;

Relação quantitativa entre a Relação quantitativa entre a VV00, a , a VVmáxmáx e a e a

[S] inicial relacionadas através de [S] inicial relacionadas através de KKmm..

SK

SVV

m

máx

0

Page 12: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Equação Michaelis-Equação Michaelis-MentenMenten

Relação numérica: Relação numérica: VV00 é metade de é metade de VVmáxmáx;;

kkmm = “afinidade” pelo = “afinidade” pelo substrato;substrato;

KKmm afinidade afinidade

máxVV 2

10

Vmáx é proporcional à [E].

Page 13: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Significado de KSignificado de Km m e Ve Vmáxmáx

Equação Michaelis e Menten = Equação Michaelis e Menten = dependência hiperbólica;dependência hiperbólica;

Mecanismos de reação diferentes Mecanismos de reação diferentes catalisam reações com 6 ou 8 passos;catalisam reações com 6 ou 8 passos;

Significado e magnitude de Significado e magnitude de VVmáxmáx e e KKmm varia;varia;

KKmm: depende de aspectos específicos do : depende de aspectos específicos do mecanismo de reação.mecanismo de reação.

Page 14: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Significado de KSignificado de Km m e Ve Vmáxmáx

KK22 << << KK-1-1 afinidade da enzima; afinidade da enzima;

KK22 >> >> KK-1-1;;

KK22 e e KK-1-1 são comparáveis a são comparáveis a KKmm função função

complexa;complexa; VVmáxmáx: número de passos da reação e : número de passos da reação e

identidade dos passos limitantes.identidade dos passos limitantes.

1

12

k

kkKm

Page 15: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Significado de KSignificado de Km m e Ve Vmáxmáx

Enzima na saturação: Enzima na saturação: EPEP e V e Vmáxmáx = = kk33.[Et];.[Et];

KKcatcat = velocidade limitante de qualquer = velocidade limitante de qualquer reação reação enzimas saturadas; enzimas saturadas;

KKcatcat e e KKmm = ambiente celular, concentração = ambiente celular, concentração do substrato e química da reação.do substrato e química da reação.

E + S ES EP E + PK1 K2 K3

K-1 K-2

Page 16: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Complexo enzima-substrato: ESv (formação) = k1 [S] [E] { v (“degradação”) = k-1[ES] + k2 [ES] = (k-1 + k2) [ES]

Estado estacionário (“steady state”): [ES] = constante

v de formação = v de “degradação” ou: k1 [S] [E] = (k-1 + k2) [ES]

[S] [E] / [ES] = (k-1 + k2) / k1 { (k-1 + k2) / k1 = Km

Constante de Michaelis

[ES] = [S] [E] / Km { [E] = [ET] – [ES] { [ES] = ([ET] – [ES]) [S] / Km

[ES] = [ET] [S] / Km – [ES] [S] / Km {[ES] + [ES] [S] / Km = [ET] [S] / Km

([ES] Km + [ES] [S]) / Km = [ET] [S] / Km { [ES] (Km + [S]) / Km = [ET] [S] / Km

[ES] = [ET] [S] / Km + [S]

Page 17: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

[ES] = [ET] ( [S] / Km + [S] )

[ES] = v / k2 [ET] = Vmax / k2

v / k2 = Vmax / k2 ( [S] / Km + [S] )

Page 18: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Variável dependente:velocidade de reação, função de [S].

Constante*:velocidade máxima

Variável independente:concentração do substrato.

Constante de Michaelis:KD aparente de ES.

* “Constante”: Vmax é função de [E]total

Page 19: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Parâmetros CinéticosParâmetros Cinéticos

Exemplo:Exemplo:

[S] (g/L) [S] (g/L) VVoo (g/L.h)(g/L.h)

0,25 0,780,25 0,78

0,51 1,250,51 1,25

1,03 1,661,03 1,66

2,52 2,192,52 2,19

4,33 2,354,33 2,35

7,25 2,577,25 2,57

0,0

1,0

2,0

3,0

0 2 4 6 8

[S] (g/L)

Vo

(g/L

.h)

Page 20: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Parâmetros CinéticosParâmetros Cinéticos

Exemplo: Lineweaver-Burk

y = 0,228x + 0,3668

R2 = 0,9991

0,0

0,4

0,8

1,2

1,6

0 1 2 3 4 5

1/[S] (L/g)

1/V

o (

L.h

/g)

L

gK

V

K

hL

gV

V

SV

VSV

K

V

mmáx

m

máxmáx

máxmáx

m

622,0228,0

73,23668,01

Portanto,

3668,01

228,01

111

0

0

Page 21: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores CompetitivosInibidores Competitivos Forma estrutural = substrato Forma estrutural = substrato

competição;competição;

Porcentual de inibição Porcentual de inibição concentrações concentrações e afinidade pela enzima.e afinidade pela enzima.

Page 22: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores CompetitivosInibidores Competitivos

[S] [S] VVmáx máx ==

KKmm Experimento Experimento • 1º 1º [E], [S] = cte [E], [S] = cte• 2º 2º [E], [I] = cte [E], [I] = cte

1/V0 x 1/[S]

Page 23: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores CompetitivosInibidores Competitivos

Equação de Equação de Michaelis e MentenMichaelis e Menten

Lineweaver-BurkLineweaver-Burk

SKIK

SVV

Im

máx

1

SV

KIK

VV máx

Im

máx

11

11

Page 24: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores CompetitivosInibidores Competitivos

ISKK

K

V

V

mI

m

I

10

Relação entre as velocidades com e Relação entre as velocidades com e sem inibidorsem inibidor

[S] [S] = influência = influência do [I] desprezível.do [I] desprezível.

Page 25: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores Não-Inibidores Não-CompetitivosCompetitivos

Ocupa outro sítio Ocupa outro sítio ESES, , EI EI ee EIS EIS;;

[S] [S] = não leva = não leva todas as todas as EE produtiva;produtiva;

VVmáxmáx e e KKmm normal.normal.

Page 26: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores Não-Inibidores Não-CompetitivosCompetitivos

Equação da Equação da velocidade:velocidade:

Lineweaver-BurkLineweaver-Burk

IIm

máx

K

IS

K

IK

SVV

11

ImáxImáx

m

K

I

VSK

I

V

K

V1

111

1

Page 27: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores IncompetitivosInibidores Incompetitivos

Bloqueio de ES;Bloqueio de ES;

2 sítios ativos 2 sítios ativos II se fixa no complexo se fixa no complexo ESES;;

ESIESI = não forma = não forma PP;;

VVmáxmáx e e KKmm

Page 28: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores IncompetitivosInibidores Incompetitivos

Equação da velocidade:Equação da velocidade:

Lineweaver-Burke:Lineweaver-Burke:

SK

IK

S

KIV

V

I

m

I

máx

1

1

Imáxmáx

m

K

I

VSV

K

V1

111

Page 29: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores IncompetitivosInibidores Incompetitivos

Page 30: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores IrreversíveisInibidores Irreversíveis

Combinam-se com um grupo funcional Combinam-se com um grupo funcional destruição;destruição;

União covalente União covalente inibidor e enzima. inibidor e enzima.

VVmáxmáx e e KKmm ==

Page 31: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores IrreversíveisInibidores Irreversíveis

Equação de Equação de Michaelis e Menten:Michaelis e Menten:

SK

SEIkVV

mmáxI

][3

Page 32: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Inibidores IrreversíveisInibidores Irreversíveis

Lineweaver-Burk:Lineweaver-Burk: SEIKV

K

EIKVV máx

m

máxI

111

33

Page 33: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência do pHInfluência do pH

Valor de pH ótimo = atividade máxima;Valor de pH ótimo = atividade máxima;

Velocidade da reação: Velocidade da reação: pH afasta do ótimo; pH afasta do ótimo;

Influência do pH: análise dos grupos Influência do pH: análise dos grupos dissociáveis;dissociáveis;

Ácidos (Brönsted): compostos capazes de Ácidos (Brönsted): compostos capazes de dissociar-se, liberando Hdissociar-se, liberando H++..

Page 34: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

bHNHCHCHCHCHNHCHCHCHCH

aHCOOCHCOOHCH

2222232222

22

Influência do pHInfluência do pH

HA HA A + H A + H++

pH pH HA HA A A

Aminoácidos:Aminoácidos:

pH pH -COO -COO-- captam prótons = -COOH; captam prótons = -COOH; pH pH -NH -NH33

++ são dissociados = NH são dissociados = NH22;;

Ligação eletrostática = -COOLigação eletrostática = -COO-- -- NH -- NH33++..

Page 35: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência do pHInfluência do pH

pH ótimo depende do número e tipo de grupos pH ótimo depende do número e tipo de grupos ionizáveis ionizáveis estrutura primária; estrutura primária;

Variações do pH Variações do pH afeta substrato com grupos afeta substrato com grupos ionizáveis;ionizáveis;

Estabilidade da enzima: temperatura, força Estabilidade da enzima: temperatura, força iônica, concentração de substratos ou cofatores iônica, concentração de substratos ou cofatores da enzima e concentração da enzima, entre da enzima e concentração da enzima, entre outros.outros.

Page 36: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência do pHInfluência do pH

pH 5 e 8 = não afeta a atividade;

Declínio entre pH 6,8-8 e 6,8-5 = forma iônica não adequada;

5 > pH > 8 = inativação irreversível.

Page 37: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência da Influência da TemperaturaTemperatura TT velocidade de reação = velocidade de reação = energia energia

cinética;cinética;

T T muito elevadas = desnaturação da enzimamuito elevadas = desnaturação da enzima• Rompidas as pontes de hidrogênio Rompidas as pontes de hidrogênio

alterações estruturas = nova conformação;alterações estruturas = nova conformação;• TT desnaturação desnaturação pouco acima da pouco acima da T T ótima. ótima.

Page 38: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência da TemperaturaInfluência da Temperatura

Enzimas PM 1 cadeia polipeptídica e pontes dissulfeto = estáveis ao calor;

Efeito da T = pH, força iônica e a presença ou ausência de ligantes;

Substratos protegem a enzima da desnaturação.

Page 39: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência da TemperaturaInfluência da Temperatura

K é função da T Lei de Arrhenius

RTekk

0

Page 40: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Influência da TemperaturaInfluência da Temperatura

Enzimas são termolábeis reação enzimática = inativação términa

Efeito da T na velocidade das reações coeficiente de temperatura

• Velocidade quando a T 10ºC.

10

log3,2 1012 QTTREa

RTekk

'0

'

Page 41: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Regulação da AtividadeRegulação da Atividade

Sistema enzimático: produto da reação da 1ª enzima substrato da enzima subseqüente;

Enzimas reguladoras determina a velocidade da seqüência;

• Atividade catalítica ou sinais;

Moléculas sinalizadoras pequenos metabólitos ou cofatores.

Page 42: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Enzimas AlostéricasEnzimas Alostéricas

Ligação não-covalente e reversível modulador;

Inibição por retroalimentação• Enzima reguladora inibida pelo P final da

via reequilibra as necessidades celulares;

Moduladores: inibidores ou estimuladores.

Page 43: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Enzimas AlostéricasEnzimas Alostéricas

Modulador = substrato homotrópicas; Modulador substrato heterotrópicas;

Sítio alostérico específico para o modulador;

Curva de saturação sigmóide subunidades múltiplas.

Page 44: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Enzimas AlostéricasEnzimas Alostéricas

curvas de variação de atividade moduladores inibidores, ativadores ou os dois tipos.

Page 45: Cinética Enzimática Prof. Dr. Henning Ulrich.

Modificação CovalenteModificação Covalente

Ligação covalente de um grupo químico à Ligação covalente de um grupo químico à sua estrutura;sua estrutura;

Metabolismo alterado Metabolismo alterado aciona vias aciona vias inativas e inibem vias ativas.inativas e inibem vias ativas.