Trabajando con RNA “un buen análisis del RNA por computadora puede decir tanto como un proyecto de 1 millón de dólares, porque es mas predecible que el DNA y las proteínas…” Juan Ospina. Candidato a Magister en Ciencias en Biomedicina Molecular [email protected]
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Trabajando con RNA
“un buen análisis del RNA por computadora puede decir tanto como un proyecto de 1 millón
de dólares, porque es mas predecible que el DNA y las proteínas…”
Juan Ospina. Candidato a Magister en Ciencias en Biomedicina Molecular
secuencia del RNA, puede introducir esta información en
mfold.
Búsqueda de secuencias de RNA en bases de datos y genomas
• Codificante (maquinaria ribosomal)• No codificante (se usa directamente)
Cortos, poco conservados Estructura 2ria
Encontrar tRNAs en el genoma• Ensamblaje de proteínas, importancia RNA no codificantes. • Difíciles de localizar en el genoma• Requieren bases de datos mas sofisticadas que el BLAST.
Servidor de la universidad de Washington en san Luisselab.janelia.org/tRNAscan-SE/.
PatScan
Permite buscar en bases de datos patrones que describan la estructura secundaria del RNA.
• Búsqueda exhaustiva, requiere dejar email y los resultados llegan en un par de horas.
miRNAs y siRNAs• Descubrimiento de RNAi en células eucariotas• Pequeños, no codificantes• Interfieren con RNA codificante • Inhibe la expresión del gen correspondiente• Es mas difícil encontrarlos en el genoma que las proteínas.
• siRNAs doble cadena• miRNAs cadena sencilla
No se conoce la cantidad en el genoma humano
Potencial herramienta médica
miR-132 se une a BDNF (factor neurotrópico derivado de cerebro) y produce daño neurológico
ENCONTRAR RNAS PARA TRABAJAR GRATIS A TRAVÉS DE INTERNET.