Bases de données thématiques en médecine Stage « Recherche documentaire en médecine : outils et ressources » Mars 2017 Catherine Tellaa ([email protected]) EM-Premium * Présentation * La recherche avancée * L’affichage des résultats * Présentation d’un document en texte intégral La Banque de Données en Santé Publique (BDSP) * Présentation * Accès à la base documentaire * La recherche simple * La recherche avancée * L’affichage et l’exploitation des résultats * Choix des préférences d’affichage Delfodoc * Présentation * La recherche simple * La recherche avancée CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones * Présentation * La recherche en langage libre * L’affichage et l’exploitation des résultats * La recherche en MeSH * La recherche experte LiSSa : Littérature Scientifique en Santé * Présentation * La recherche en langage libre * La recherche avancée * L’affichage des résultats * La recherche experte * La recherche par mots-clés MeSH * L’exploitation des résultats Kinédoc
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Bases de données thématiques en médecine Stage « Recherche documentaire en médecine : outils et ressources »
Les guillemets ("...") permettent de figer une expression ou un groupe de mots.
Ex. : "menace d’accouchement prématuré"
La casse : la plupart des bases sont insensibles à la casse (minuscules/MAJUSCULES). D’une manière
générale, il est préférable de saisir les termes de recherche en minuscules.
Les accents (à, é, è, ê…) et les signes diacritiques (ç…) sont à éviter de préférence
lors de l’interrogation.
Les mots vides (le, la, les, l’, un, une, de, des, the, a, à…) sont des mots ignorés lors
de l’interrogation. Dans certaines bases, il est possible de forcer leur interrogation à l’aide du signe "+".
Ex. : grippe +a
La ponctuation : les parenthèses servent généralement à combiner plusieurs opérateurs booléens.
Langue d’interrogation : anglais ou français selon le producteur de la base.
Langage contrôlé / langage naturel : certaines bases s’appuient sur un langage contrôlé ou
thesaurus. Dans le cas d’une base indexée à l’aide d’un thesaurus, une recherche complémentaire en langage naturel peut s’avérer utile, voire indispensable, pour rechercher une notion récente, mal indexée
ou compenser une indexation insuffisante des documents recensés.
En préalable...
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 4
EM-Premium
Présentation
Producteur : Elsevier-Masson
Type de données : portail spécialisé dans le domaine médical et paramédical
Contient l'Encyclopédie médico-chirurgicale (EMC), divisée en 45 traités thématiques
Permet la consultation en ligne de 130 revues médicales françaises et 80 revues médicales anglaises
Contient aussi des livres électroniques en français et en anglais
Le formulaire de recherche permet d'interroger simultanément les traités EMC, les revues et les livres.
Langues : anglais et français
Langue d’interrogation : français
Couverture chronologique :
depuis 1970 (traités)
variable (revues)
Couverture géographique : France
Interrogation : langage naturel
Consultation : sur abonnement, plusieurs formules possibles :
Avec ou sans le traité de "Biologie médicale"
Avec ou sans le pack "Univers infirmier"
Sélection de revues
Avantages :
Français
Traités thématiques permettant d’obtenir une synthèse sur un sujet (utile pour débuter une recherche)
Pour savoir à quoi vous êtes abon-
nés, cliquer sur :
« Accéder à tous vos produits »
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 5
EM-Premium
La recherche avancée
Préférer la recherche avancée à la recherche simple.
Saisir les mots-clés dans la barre de recherche.
Le filtre "Titre, mots clés, résumé" permet de mieux
cibler la recherche.
Par défaut, l'opérateur booléen sous-entendu est OU.
Pour associer plusieurs mots-clés avec l'opérateur ET,
il est nécessaire de faire précéder chaque terme du
signe "+".
Limiter éventuellement les résultats à une
période chronologique précise.
« Dans un produit » : lance la recherche dans
l’intégralité de la plateforme.
« Dans mes abonnements » : limite les résul-
tats aux ressources auxquelles la bibliothèque est
abonnée.
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EM-Premium
La recherche avancée
Cliquer sur "Plus d’options" pour afficher
les différentes possibilités de recherche.
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EM-Premium
Rappel de la stratégie de recherche
Par défaut, les résultats sont classés par ordre de pertinence.
Un tri chronologique est également possible.
L’affichage des résultats
Tri des résultats par langue (français / anglais)
Possibilité de rechercher dans la
liste de résultats.
Résultats de la recherche
En passant la souris sur le titre de la
revue, le nombre de résultats dans
cette revue, apparait.
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EM-Premium
L’affichage des résultats
Titre du traité ou de la
revue
Cliquer sur le titre pour limiter la recherche à cette
ressource
Indication du type
de document :
Indication du degré de pertinence
Traité
Revue
Livre
électronique
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EM-Premium
Titre du traité ou référence de l’article
dans la base (voir aussi en bas de page).
Accès au document au
format PDF.
Accès direct à l’iconogra-phies et aux documents
d’accompagnement (autoévaluation, arbre
décisionnel, fiche
d’information patient…).
Résumé
Mots-clés
Plan cliquable
Bibliographie en fin
de document
Présentation d’un document en texte intégral
Il est possible de récupérer cette
référence dans Zotero mais la ré-cupération du texte intégral peut
ne pas se faire de façon automa-
tique.
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 10
Exercice : interroger la base EM-Premium
Dans EM-Premium, rechercher des documents sur la Borréliose de Lyme chez l’enfant.
Obtenez-vous des traités dans vos réponses ?
EM-Premium
Bases de données thématiques en médecine
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Domaine : santé publique
Producteur : École des hautes études en santé publique (EHESP), avec l'appui du réseau BDSP qui est un
groupement de 40 centres de documentation et d'organismes spécialisés.
Type de données : environ 500 000 références d’articles de revues fondamentales, d’ouvrages, de thèses, mémoires et autres travaux académiques, de rapports, d’actes de congrès, de retours d’expériences, à destination des professionnels de santé et des
patients. Un certain nombre de documents sont accessibles en ligne.
Le site propose également des bibliographies élaborées par des professionnels de l'information, un annuaire critique de sites, une
base de colloques, un glossaire multilingue et des offres d'emploi.
Langues : français et anglais
Langue d’interrogation : français
Couverture chronologique : depuis la fin des années 1970
Couverture géographique : internationale
Mise à jour : mensuelle
Interrogation :
Langage naturel
Thesaurus de la BDSP
Consultation : libre et gratuite à l’adresse http://www.bdsp.ehesp.fr/base/
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 26
CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
La recherche en langage libre
L’outil Doc’CISMEF est un moteur de recherche qui permet d’interroger l’ensemble des ressources du portail.
Le système accepte les opérateurs booléens (ET implicite), la troncature (*) et les guillemets.
Possibilité de limiter par type
de document
Bases de données thématiques en médecine
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CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
L’affichage des résultats
Historique de recherche (au cours
d’une session)
Relancer la recherche dans d’autres
moteurs et bases de données :
PubMed, Google...
Filtres permettant d’affiner la
recherche :
- par source : OMS, HAS, Ministère de la
Santé…
- par type de document : recommanda-
tion de santé publique, article de revue, rapport, thèse ou mémoire, document
produit par une association profession-
nelle de santé…
- par mots-clés ayant servi à décrire les
ressources
- par niveau d’études (PACES, 1er
cycle…)
- par pays : France, Canada, etc.
- par année de publication.
Les résultats sont affichés par
ordre antéchronologique
Suggestion de descripteurs MeSH
pour relancer la recherche
Descripteurs MeSH en rapport avec
la recherche saisie en langage libre
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Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 28
CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
L’affichage des résultats
Lien cliquable vers le document
Afficher la
notice complète
Attention, le CISMEF n’est pas compatible avec Zotero.
Afficher les mots-clés MeSH ayant servi
à l’indexation de la ressource Type de
document
Afficher l’URL
de la ressource
Date de la ressource
Détails d’une référence :
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 29
CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
La recherche en MeSH à l’aide du Portail Terminologique de Santé (HeTOP)
L’ensemble des ressources du CISMeF sont indexées en MeSH français. Il est possible d’interroger la base à l’aide du MeSH en
passant par le Portail Terminologique de Santé.
2. Cliquer sur l’onglet
"PubMed / Doc’CISMeF"
4. La recherche a bien porté sur les ressources indexées avec le mot-clé MeSH
"vaccins antigrippaux/administration et posologie"
3. Cocher éventuellement un qualificatif et lancer la recherche en cliquant
sur "Doc’CISMeF" en bas de la page
1. Lancer la recherche dans le Portail Terminologique de Santé et afficher la notice du mot-clé MeSH correspondant :
Bases de données thématiques en médecine
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Dans le CISMeF, rechercher en langage libre des documents sur la prévention de la bronchopneumopathie chronique obstructive. A l’aide des filtres, isoler les ressources produites par le Centre Cochrane français. Combien de résultats trouvez-
vous ?
Effectuer ensuite une recherche en MeSH sur le même sujet à l’aide du Portail terminologique de Santé. Combien de résultats
Exercice : trouver des documents dans le CISMeF
CISMeF : Catalogue et Index des Sites Médicaux Francophones
Bases de données thématiques en médecine
Bibliothèque interuniversitaire de Santé— URFIST de Paris — Mars 2017 31
LiSSa : Littérature Scientifique en Santé
Présentation
Domaines : médecine et santé
Producteur : CHU de Rouen
LiSSa est un projet supporté par l'ANR avec 5 partenaires : Équipe CISMeF (CHU de Rouen) ; Équipe d'Accueil 2694 "Santé
Publique : épidémiologie et qualité des soins" (Lille) ; Elsevier Masson ; Alicante (qui développe SIGAPS/SIGREC) ; SenseGates
(société qui produit le dictionnaire Sensagent).
Le site actuel est un prototype, dont certaines fonctionnalités (recherche avancée, envoi des références par mail,
interface pour tablettes et smartphones...) sont pour le moment annoncées et en cours de développement, projet définitif prévu
pour mars 2018.
Type de données : plus de 865 000 références d’articles de périodiques (en février 2017), issues de 640 revues :
Comprend le contenu francophone de PubMed
Comprend des articles de revues non incluses dans PubMed
Comprend les traités de l’EMC
Plus de 35 000 liens vers des articles gratuits sont référencés dans LiSSa. La liste complète des revues est disponible à l’adresse