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ão, radução Universidade Federal Rural do Rio de Janeiro Campus do Seropédica Departamento de genética Replicaçã transcrição e tr Prof: Valdir Diola [email protected]
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Aula 2 replicação, transcrição e tradução

Aug 12, 2015

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Page 1: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

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Universidade Federal Rural do Rio de JaneiroCampus do SeropédicaDepartamento de genética

Re

pli

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riçã

o e

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ção

Prof: Valdir Diola

[email protected]

Page 2: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Conteúdo

- Replicação

- Dogma central da biologia

- Complexo de replicação

- Duplicação semiconservativa

- Herança genética

- Organização do material

- Tradução

- Ribossomos

- Processamento

- Código degenerado

- Mecanismo de tradução

- Organização do material

genético

- Transcrição

- Ativação da expressão gênica

- Mecanismo de transcrição

- Síntese de RNA e

processamento

- Expressão fenotípica

- Endereçamento de proteínas

- Regulação pós traducional

Page 3: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Dogma central da Biologia

ReplicaçãoDuplicação do DNA

TranscriçãoSíntese de RNA

Núcleo

TraduçãoSíntese de

Proteínas

Núcleo

CitoplasmaMembrana nuclear

Proteína

Ribossomo

Page 4: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

A biossíntese de proteínas insere-se no dogma central da biologia

Sede da informação

Ácido desoxirribo-

nuclêico

da biologia molecular

Processo

comprovado

Processo não

comprovado

Ácido ribonuclêico

Page 5: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 6: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Replicação do DNA é semiconservativa

F1

G

A

F2

C

T

F2’

C

T

F1’

G

A

F1 F2

A

A

T

A

C

T

T

A

T

G

T

T

A

T

G

A

A

T

A

C

Page 7: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

FASES DO CICLO CELULAR

(célula mitótica = célula somática)

Replicação do DNA

Início do cicloCélula se

Divisão celular

G1

síntese de RNA e proteínas.

duplicação do par de centríolo

S

Síntese do DNA e

Duplicação do DNA (2C/4C)

G2

Preparação para divisão celular

Síntese de RNA e proteínas

Crescimento celular

Decisão celular

Replicação do DNA

prepara para dividir

Page 8: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Replicação do DNASemiconservativa

Helicase

Girase

Fita contínua

Fita descontínua

Fita contínua

Fita contínua

Origem da Replica-ção (DNA ABC)

Fita descontínua

Orientação da replicação

Proteínas de

ligação no DNA

Forquilha de replicação

Fragmento de Okasaki

Fita contínua

Fita descontínua

Orientação da replicação

Page 9: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

PROTEÍNA FUNÇÃODNA girase Desespiraliza o DNA

SSB Ligação e estabilização da fita simples do DNASSB Ligação e estabilização da fita simples do DNADnaA Fator de iniciaçãoHU Ligação e estabilização do DNA (semelhante a histonas)

PriA Montagem do primosso, 3'→→→→5' helicasePriB Montagem do primossomoPriC Montagem do primossomoDnaB 3'→→→→5' helicase (desespiraliza o DNA)DnaC Chaperona DnaBDnaT Auxilia o DnaC na liberação do DnaB

Primase (iniciase) Síntese do primer de RNADNA polimerase III Elongação (síntese propriamente dita do DNA)DNA polimerase I Elimina o primer de RNA, preenchendo com DNA

DNA ligase Liga covalentemente os fragmentos de OkazakiTer Término

Page 10: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Organização dos cromossomos

(Compactação de 57 mil vezes)

10,8 pb por voltaReduz 4 vezes o tamanho

da molécula de DNA

O superenovelamentopermite armazenar grande

quantidade de informaçãp

genética em pouco

espaço – uma célula

da molécula de DNA

Page 11: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Cromossomo: uma dupla hélice de DNA + proteínas associadas

Cromatina

Cromossomo

(DNA + Proteínas

histonas e não histonas

+ RNA)

Eucromatina HeterocromatinaMaterial densamente

corado, mais condensada

Material levemente corado,

onde está situado a maioria

dos genes

+ RNA)

Page 12: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

A cromatina pode estar condensada ou estendida

Níveis de metilação (condensação) ou acetilação (linearização) dos resíduos de lisina das histonas atuam no grau de condensação da cromatina

Page 13: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 14: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Nucleossomo

•Octamero de histonas (proteínas)

•Histona H1 – externamente

Page 15: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Níveis de compactação

•Pelo menos três níveis de condensação para

acondicionar todo DNA nos cromossomos.

1- Embalagem do DNA no nucleossomo

Page 16: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

2- Dobramento adicional ou superelicoidização do conjunto de nucleossomos.

Níveis de compactação

Page 17: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

3-Proteínas cromossômicas não histonas formam umarcabouço – protege DNA da degradação.

•Removidas as Histonas

Níveis de compactação

•Removidas as Histonas

Proteínas cromossômicas não-histonas.

DNA

Page 18: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 19: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

O Cromossomo

Braço

curto

(p)

telômeros

Espécie 2n Espécie 2n

Drosófila 8 Centeio 14

Humano 46 Milho 20

Coelho 44 Tomate 24

Duas cromátides

Braço

longo

(q)

Heterocromatina (densa) e eucromatina (região gênica)

Coelho 44 Tomate 24

Cavalo 64 Trigo 14

Caracol 24 Feijão 22

Minhoca 32 Arroz 24

Carneiro 54 Cana-de-açúcar 20

Porco 40 Samambaia 1200

Page 20: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Transcrição

Cadeia

Aminoácidos

Anticodon

Deoxiribonu-

cleotídeos

RNA

polimerase

Síntese de Proteína

Tradução

Cadeia

peptídica

RibossomoCodon

Membrana

nuclear

cleotídeos

Page 21: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 22: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 23: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 24: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

1 TBP (TATA binding Protein) orienta a ligação do TFIID que se liga a região TATA box

2 Ocorre a interação entre

Formação do Complexo de Iniciação da Transcrição

2 Ocorre a interação entre TFIIA e TFIIB para iniciar a formação do complexo

3 O complexo de inicio de transcrição se forma pela interação da RNA Pol II com o complexo protéico e o DNA na posição -30 a -10.

Page 25: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

4. TFIIE, TFIIH e TFIIJ então se juntam ao complexo.

Formação do Complexo de Iniciação da Transcrição

5.TFIIH usa ATP para fosforilar a RNA-polimerase II, mudando a sua conformação de forma que a RNA-polimerase é liberada do complexo e é capaz de iniciar a transcrição.

Page 26: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Adição da estrutura 5’ Cap dos mRNAs

Page 27: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Regulação Funcional (o processamento do mRNA)

A presença de intons

em mRNA é ou fator

de regulação dos

genes

Genes eucariotos,

especialmente de especialmente de

plantas possuem

sequencias intrônicas

de até mais de 1 kb

Um gene pode

codifcar para várias

proteínas: “Splicing alternativo”

Page 28: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Algumas informações

sobre íntrons

• 3,7 íntrons por kb de região

codificadora

• No homem o número médio

é de 5 íntrons por gene

Regulação Funcional(processamento do RNA)

é de 5 íntrons por gene

• 94% dos genes contém

íntrons

• O tamanho médio dos

íntrons é de 125 pb

• O tamanho médio dos

éxons é de 90 a 120 pb (30

a 40 aa)

Page 29: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Adição da caudaPoli(A) ao pre-mRNA

Eucariótico

PoliadenilaçãoPoliadenilação

Page 30: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 31: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 32: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 33: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

As moléculas de tRNA tem padrões comuns

1. São cadeias simples conten-do entre 73 e 94 nucleotídeos

2. Contém muitas bases inco-muns (7 a 15 por molécula)

3. A terminação 5' é fosfori-lada; o resíduo 5'-terminal emgeral é pG

4. A sequência 3' terminal ésempre CCA; é o sítio de ligaçãosempre CCA; é o sítio de ligaçãodo aminoácido

5. Metade dos nucleotídeos es-tão pareados formando duplahélice; mas, há regiões quenunca estão pareadas como aalça (loop) TΨΨΨΨC, por exemplo)

6. O anticódon é complementarao códon. A alça anticódon temum padrão característico: a)duas pirimidinas antes; b) umapurina modificada depois.

Page 34: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 35: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Código degenerado

Mutação silenciosa – AGC/AGU não altera o aaMutação de sentido errado – AGC/AAC – ser/aspMutação sem sentido – UCA/UAA terminaçãoAdição ou deleção – altera o código de leitura

Page 36: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Costuma-se dividir a síntese de proteínas em três etapas: iniciação, elongação e terminação

A iniciação consiste na formação do chamado complexo de iniciação:

a) Ribossomo completo

b) mRNA posicionado

c) tRNA de iniciação ligado ao aminoácido de iniciação (Met ou formil-Met) posicionado no iniciação (Met ou formil-Met) posicionado no chamado sítio P (peptidil do ribossomo)

Page 37: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 38: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Em procariotos o sinal de início é AUG (ou GUG), precedido de várias bases que pareiam com o rRNA 16S

Sequências de Shine-Dalgarno

Page 39: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

A ligação de cada aminoácido ao tRNA correspondente é feito por sintetases específicas:

Aminoacil-AMP + tRNA Aminoacil-tRNA + AMPAminoacil-AMP + tRNA Aminoacil-tRNA + AMP

PPi 2Pi

∆∆∆∆Go' < 0

Aminoácido + ATP + tRNA aminoacil-tRNA + AMP + 2Pi

O aminoácido é esterificado ao grupo hidroxila 2' ou 3' da adenosina terminal do tRNA

Page 40: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Ligação do aminoacil-tRNA

Transpeptidação

Trans-locação

Page 41: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 42: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Vários ribossomos podem traduzir simultaneamente uma molécula de mRNA

Os ribossomos movem-se ao longo de um mRNA na direção 5'→3'

O conjunto é conhecido como polissomo ou polirribossomo

Cada ribossomo funciona independentemente dos demais

Page 43: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

Códon de terminação

Page 44: Aula 2   replicação, transcrição e tradução
Page 45: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

DNA

pré mRNA

mRNANúcleo

Citoplasma

Transcrição

Transporte

Processamento

capeamento

poliadenilação

splicing

Controle

transcricional

proteína

mRNA

TraduçãoDegradação

Estocagem

Proteínaativa/inativa

mRNA inativo

Modificações

Pós traducionais

Expressão gênica

em eucariotos

Controle

pós transcricionallocalização

estabilidade

João B. N. Aguiar

Page 46: Aula 2   replicação, transcrição e tradução

RNA polimerase

Sítio de início de

transcrição

Sítio de

terminação

Promotor

Cap exon 1 intron1 exon 2 intron 2 exon 3 poliA AAAAARNA

Expressão Fenotípica

mRNA

tradução

Ribos-

somo

aas

Conformação primária

da proteína (linear)

Conformação quaternário da

proteína (máx enovelamento)

Fenótipo $

$

$

$

$

$