Afghanistan Polio Eradication Initiative

Page 1

Afghanistan Polio Eradication Initiative

Surveillance Update Week 30

(Ending on Saturday 26 July 2008)

National Surveillance Office

July 29, 2008

Page 2

AFP Case Classification Afghanistan 2008

Data up to 26 July 08

Year 2008

Reported AFP cases 779

Confirmed 13

Compatible 0

Discarded 705

Pending 61*

*43 AFP cases pending lab results

13 Inadequate AFP cases pending 60 days follow up

05 AFP cases pending ERC

Page 3

Recent NSL1 from, Spin Boldak District of Kandahar Province, onset is 3 Jul, age 24m, 2 OPV doses

Recent NSL3 from, Jalalabad District of Nangarghar Province, onset is 14 May, age 08m, 10 OPV doses

NSL1=09NSL3=04Comp=0

2008

Confirmed Polio cases & Compatibles Afghanistan 06-08

2006

NSL1=29NSL3=02Comp=06

NSL1=06NSL3=11Comp=02

2007

Data up to 26 July 08

NSL1=1NSL3=1Compatible=1

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Polio cases are placed by village of onset & residence

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2007

NSL1=06

NSL3=11

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2004

NSL1= 2

NSL3= 2

1999

NSL1= 45

NSL3= 18

P1 & P3 Poliovirus Isolates Afghanistan 1999, 04, 06-08

2006

NSL1=29

NSL3= 2

NSL1=09

NSL3=04

Data up to 26 July 08

2008

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NSL1=1NSL3=1Compatible=1

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Afghanistan & Pakistan P1 isolatesby genetic cluster Jan to June 08

Data up to 26 July 08

Cluster A-3D

01 Jan 08 Nawabsha

25 Feb Shikarpoor

06 Apr Nferoz

09 Apr Jacobabad

Cluster B-4A

14 May Kohat

Cluster A-3A

10 Feb Balab uluk07 Mar Maywand

12 Jan Nadi Ali20 Jan Nadali

05 April Mir pur khas

25 Jan Haidrabad

01 April Khinorth

23 Apr Dadu

12 May Sanghar14 May Khisite30 May Kabdullah

04 Jun Pishin03 Jun Maywand28 May Ghorak

24 Jun Trinkot01 Jul Swat

22 Jun Sahidi Hassas

03 Jul SpineBoldak

Unclassified

03 Jul Swat

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Afghanistan & Pakistan P3 isolatesby genetic cluster Jan to June 08

Cluster B-1C

Data up 26 July 08

09 Feb Maywand

15 Apr Balabuluk

15 Apr Shah Wali Kot

27 Apr Nowshera

14 May Jalalabad

14 May Nowshera

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Oct

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Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Apr

May

Jun

Jul

Aug Sep

Oct

Nov

Dec

No

of c

ases

Polio Virus Isolates By Type & Month, Afghanistan 05-08

2005

tOPV mOPV1 mOPV3 sNID NID

2006 2007 2008

Short interval additional dose

NSL1

NSL3 Data up to 26 July 08

Page 8

List Of Confirmed Polio Cases Afghanistan 2008

Data up to 26 July 08*Confirmed by contact

No Epid Province District Donset Prop Fever Asym Sex Age Routine SIAsDlast OPV

Dstool 1 Dstool2 Hcase LabR Cluster

1 AFG/08/08/001 HILMAND NAD ALI 12-01-08 Y Y N M 28 0 3 28-10-07 15-01-08 16-01-08 YES NSL1  A3A

2 AFG/08/08/005 HILMAND NAD ALI 20-01-08 Y Y N M 11 0 1 20-09-07 25-01-08 26-01-08 No NSL1   A-3A

3 AFG/08/08/012 KANDAHAR MAYWAND 09-02-08 Y Y Y M 84 0 15 No date  14-02-08 15-02-08 No NSL3   B1C

4 AFG/03/08/012 FARAH BALABULUK 10-02-08 Y Y N F 26 0 2 22-04-07   20-02-08 21-02-08 No NSL1 A3A  

5 AFG/08/08/027 KANDAHAR MAYWAND 07-03-08 Y Y Y M 14 5 12 09-03-08   13-03-08 14-03-08 YES NSL1 A3A  

6 AFG/03/08/041 FARAH BALABULUK 15-04-08 Y Y Y F 16 0 12 13-04-08   18-04-08 19-04-08 YES NSL3 B1C

7 AFG/08/08/045* KANDAHAR SHAHWALIKOT 25-04-08 Y Y N M 12 0 0 No date   30-04-08 Died No NSL3 B1C 

8 AFG/06/08/070 NANGARHAR JALALABAD 14-05-08 Y Y N M 8 4 6 15-05-08 16-05-08 Died No NSL3 B1C

9 AFG/08/08/063 KANDAHAR GHORAK 28-05-08 Y Y Y M 30 0 0 No date 01-06-08 02-06-08 YES NSL1 A-3A

10 AFG/08/08/071 KANDAHAR MAYWAND 03-06-08 Y Y N F 66 0 5 No date 10-06-08 14-06-08 No NSL1 A-3A

11 AFG/08/08/081 UROZGAN TARINKOT 24-06-08 Y Y Y M 18 0 0 No date 01-07-08 02-07-08 YES NSL1 A-3A

12 AFG/08/08/078 UROZGANSHAHID

HASSAS22-06-08 Y Y N M 10 4 5 01-06-08 27-06-08 28-06-08 NO NSL1 A-3A

13 AFG/08/08/087 KANDAHAR SPIN BOLDAK 03-07-08 Y Y Y F 10 0 2 29-06-08 14-07-08 15-07-08 YES NSL1 PEND

Page 9

Regional Reference Lab Update Afghanistan-2008

Data up to 26 July 2008

*AFG/03/08/041(Index case along with 2 Contacts are NSL3)

AFG/08/08/045 (Index case EV but 1 contact is NSL3)

Month of onset CasesCases under process

Negative cases

NPEV positive

NPEV %Within 28

days

Positive cases

Culture ITD Wild Vaccine

Jan 97 0 0 79 10 10% 100% 2 7Feb 112 0 0 88 14 13% 100% 2 8Mar 115 0 0 74 14 12% 100% 1 26Apr 125 0 0 83 30 24% 100% 1 14May 132 0 0 83 41 31% 100% 2 7Jun 139 1 0 93 40 29% 99% 3 2Jul

31 6 0 15 8 26% 81% 1 1Week 1

Jul19 17 0 2 0 0% 11% 0 0

Week 2Jul

7 7 0 0 0 0% 0% 0 0Week 3

Jul1 1 0 0 0 0% 0% 0 0

Week 4Jul total 58 31 0 17 8 14% 47% 1 1

Total AFP cases 778 32 0 517 157 20% 96% 12 65 (8.35 %)

Contact Specimens

429 36 0 275 87 20% 92% 3* 28 (6.52 %)

Page 10

AFP Cases Pending ERC, Afghanistan 2008

Data up to 26 July 08

EPID DONSET District Province Sex Age DosesDstool2 (or 1)

Asym Progress FeverLab

result60d follow-up result

AFG/01/08/095 13-04-08 TALUQAN TAKHAR M 132 7 04-06-08 YES YES YES NVI RES WEAK

AFG/08/08/047 17-04-08 QALAT ZABUL M 48 14 06-05-08 YES YES YES NVI RES WEAK

AFG/02/08/077 20-04-08 BILCHIRAGH FARYAB F 144 2 12-06-08 NO YES YES NVI RES WEAK

AFG/06/08/082 28-04-08 SHINWAR NANGARHAR M 36 16 12-06-08 YES YES YES EV RES WEAK

AFG/08/08/080 27-06-08 ARGHANDAB ZABUL F 6 1 28-06-08 NO YES YES EV DIED

Page 11

AFP Cases Pending Classification >90 days, Afghanistan 2008

Data up to 26 July 08

EPID DONSET District Province Sex Age DosesDstool2

(or 1)Asym Prog Fever

Lab result

Days since onset

Reason for not being classified

AFG/01/08/095 13-04-08 TALUQAN TAKHAR M 132 7 04-06-08 YES YES YES NVI 106 PEND ERC

AFG/01/08/084 14-04-08 ARCHI KUNDUZ M 84 20 15-05-08 NO YES YES EV 105 PEND FUP

AFG/08/08/047 17-04-08 QALAT ZABUL M 48 14 06-05-08 YES YES YES NVI 102 PEND ERC

AFG/02/08/077 20-04-08 BILCHIRAGH FARYAB F 144 2 12-06-08 NO YES YES NVI 99 PEND ERC

AFG/06/08/082 28-04-08 SHINWAR NANGARHAR M 36 16 12-06-08 YES YES YES EV 91 PEND ERC

Page 12

AFP Cases Labeled As Hot & Pending in Lab, Afghanistan 2008

Hot by criteria=AFP cases have (Fever + rapid progress+ Asymmetric paralysis + Age <48 month)

* UP= Under Process in the Lab Data up to 26 July 08

EPID DONSET District Province Sex Age DosesDate of

last OPVDstool2 (or 1)

Hot by field

Hot by criteria

Lab result

AFG/03/08/087 05-07-08 INJIL HIRAT F 24 10 13-04-08 08-07-08 YES YES UP

AFG/03/08/090 07-07-08 CHAGHCHARAN GHOR M 12 4 18-05-08 14-07-08 YES YES UP

AFG/03/08/089 13-07-08 KHAKI SAFED FARAH M 28 10 28-06-08 17-07-08 YES YES UP

AFG/08/08/091 14-07-08 TIRIN KOT URUZGAN M 30 1 30-06-08 19-07-08 YES YES UP

AFG/08/08/080 27-06-08 ARGHANDAB ZABUL F 6 1 02-06-08 28-06-08 YES NO UP

AFG/03/08/091 12-07-08 SHINDAND HIRAT F 48 16 13-04-08 19-07-08 YES NO UP

Page 13

Reported AFP Cases, Comparison By Month, Afghanistan 06-08

@ of 2/100,0000 <15 year

@ of 1/100,0000 <15 year

0102030405060708090

100110120130140

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

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Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

Au

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ep Oct

Nov

Dec

Jan

Feb

Mar

Ap

rM

ay Jun

Jul

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gS

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Nov

Dec

Nu

mb

er o

f ca

ses

2006 2007 2008

Data up to 26 July 08

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AFP Cases By Week Of Onset Afghanistan 2008

Week (Sun-Sat)

Expected “2”= Two AFP cases/100,000 <15 yrs Good AFP= GBS or T. Myelitis, T. Neuritis

Data up to 26 July 08

Region

AFP Cases 2008Week Number

19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30Exp

ect “2”

Rep

orted

Good

AF

P

10-May

17-May

24-May

31-May

07-Jun

14-Jun

21-Jun

28-Jun

05-Jul

12-Jul

19-Jul

26-Jul

Badakhshan 10 21 6 0 1 1 1 2 0 1 0 0 1 0 0

Central 62 181 66 7 9 9 7 8 8 6 14 6 2 5 0

Eastern 29 108 41 5 9 3 5 3 3 5 3 6 4 1 1

Kunduz 38 138 54 2 3 5 4 5 6 11 7 6 4 2 0

Northern 46 96 33 2 2 3 2 5 4 4 2 6 1 0 0

South East 34 51 20 2 2 0 3 1 1 0 1 1 4 1 0

Southern 57 92 36 7 5 2 3 9 1 2 5 4 3 2 0

Western 54 92 39 7 3 6 1 4 3 2 2 2 3 1 0

Afghanistan 329 779 295 32 34 29 26 37 26 31 34 31 22 12 1

Page 15

Population Density Map Afghanistan 2008

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Hirat

Farah

Ghor

HilmandNimroz Kandahar

Badakhshan

Uruzgan Ghazni

Balkh

Zabul

Faryab

Paktika

Baghlan

Badghis

Sari Pul

Takhar

Bamyan

Jawzjan

Parwan

Wardak

Nuristan

Samangan

Kunduz

Paktya

KunarKabul

Nangarhar

Khost

Pakistan

Uzbakistan

Turkmanistan

Iran

Tajikistan

China

Dot=10 Persons/Sq Km

Page 16

Non-Polio AFP Rate by Province, Afghanistan per 100,000 under 15 years

2008

2007

2006

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Data up to 05 July 2008

2.96

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% of AFP cases reported within 7 days of paralysis onset by region Afghanistan 06-08

Data up to 26 July 08

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Proportion Of Adequate Stools By Region Afghanistan 06-08

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AFP Cases with Stool Specimen Reaching The RRL Within 3 and 7 Days of 2nd Specimen Collection By Region, Afghanistan 06-08

Within 3 days

Within 7 days

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Data up to 26 July 08

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Percentage of Entero -Virus and SL isolation Afghanistan 06-08

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Data up to 26 July 08