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lnl UNIL I Université de Lausanne UNIVERSITE DE NEUCHÂTEL Maîtrise universitaire ès Sciences en biogéosc¡ences Master of Science (MSc) in Biogeosciences Faculté des géosciences et de I'environnement Université de Lausanne Faculté des sciences Université de Neuchâtel Plan d'études Entrée en vigueur I 14 septembre 2015 llllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllililililililililililililililililililililililiiiiiiiiiit Site internet de la maîtrise universitaire : www.biooeosciences.ch UNIL - Faculté des géosciences et de l'environnement I www.unil,ch/qse UNINE - Faculté des sciences I www2.unine,ch/sciences
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Sep 16, 2018

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lnlUNIL I Université de LausanneUNIVERSITE DENEUCHÂTEL

Maîtrise universitaire ès Sciences en biogéosc¡ences

Master of Science (MSc) in Biogeosciences

Faculté des géosciences et de I'environnementUniversité de Lausanne

Faculté des sciencesUniversité de Neuchâtel

Plan d'études

Entrée en vigueur I 14 septembre 2015llllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllllililililililililililililililililililililililiiiiiiiiiitSite internet de la maîtrise universitaire : www.biooeosciences.chUNIL - Faculté des géosciences et de l'environnement I www.unil,ch/qseUNINE - Faculté des sciences I www2.unine,ch/sciences

Page 2: 20150706-080825-Scan depuis PrintGSE02 - unil.ch · De niveau 2è'" cycle, ce programme de formation de 120 crédits ECTS a une durée prévue de quatre semestres après le Baccalauréat

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Maîtrise universitaire ès Sciencesen biogéosciences

Master of Sciences (MSc)in Biogeosciences

2015 - 2016Dans ce document, le masculin est ut¡lisé à t¡tre générique,

tous les titres et tonctions doivent être entendus comme mascul¡ns et téminins.

La Maîtr¡se universitaire ès Scrences en biogéosciences / Master of Sciences (MSc) in Biogeosciences[ci-après Maîtrise universitaire en biogéosciences] est organisée conjointement par la Faculté desgéosciences et de l'environnement de l'Université de Lausanne et la Faculté des sciences del'Université de Neuchâtel.

De niveau 2è'" cycle, ce programme de formation de 120 crédits ECTS a une durée prévue de quatresemestres après le Baccalauréat universitaire. Il est donné en françars.

Cadre général

La Maîtrise universitaire en biogéosciences représente le fruit de l'intégration de deux domaines dessciences naturelles : la biologie et la géologie. Il repose sur l'émergence de nouveaux champs derecherche aux frontières multiples de ces deux disciplines. Son objectif principal est la préparation desétudiant-e-s à de nouvelles disciplines trans-thématiques fondées sur une approche intégrée deI'environnement naturel et anthropisé.Le programme de la Maîtrise universitaire en biogéosciences assure une approche trans-disciplinaire.Il s'articule autour de champs disciplinaires présents au sein de la Faculté des géosciences et del'environnement de I'Université de Lausanne et de la Faculté des sciences de l'Université deNeuchâtel :

Disciplines liées à l'étude géologique et biogéochimique des environnements naturels etanthropisés.Ces disciplines concernent la dynamique des sédiments de surface et leur histoire, les transferts d'élémentsentre les divers réservoirs de la géobiosphère et leur caractérisation à des échelles de temps et d'espacevaria bles.

Disciplines liées à la connaissance des mécanismes fondamentaux de I'interface biologie-géologie que constitue le sol .

Ces disciplines reposent sur les concepts de la science du sol, de la biologie des sols, et de leurbiogéochimie. Elles traitent aussi bien les mécanismes de la pédogenèse que leur répartition spatiale, sansoublier le rôle essentiel de la végétation.

Disciplines liées à la connaissance des interactions entre le minéral et le vivant à l'échelle desmtcroorgantsmes.Ces disciplines renvoient aux problémat¡ques relat¡ves au rôle des microorgan¡smes dans le façonnement delépiderme terrestre et des échanges d'énergie et de matière qui s'y manifestent.

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3

Plan d'études 2015-2016 | Maîtr¡se universitaire ès Sciences en b¡ogéosciences I Master of Sc¡ence (MSc) ¡n B¡ogeosciences

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U'Fol¡læç

-2-Le programme de formation est organisé autour de modules d'enseignements. Il permet unespécialisation dans deux orientations spécifiques (formation spécialisée). Les informations qui suiventen présentent succinctement la structure. Le programme est ensuite décrit d'une manière détailléedans le présent Plan d'études.

Maîtrise universitaire en biogéosciences

+

+

Frojet de recherche (module M7)

UIo3o(nafD

PIDd

U't-oIIJGI

U'oUJ.o

ü,oIU-tr.l,

+ + +(tla-tJ'|(-¡l

tu

è

Mémoire de recherche (modute M8)

ltllodules de tronc communM1

Aequisl'fionsdes þases

6 ECTS

+M2

MéthadesAna gues ef

techniques -12 ECTs

+M3àM5

Fom¡alianPrincipaie

30ECÏS

Module de spécialisation M6

Au cl'loix',\

1,'t' - - -\

Spécialisation L

lnte¡actlons entreSof ef Végétatian

Spécialisation 2

lnteractiøns dansfa Géoöiospfière

Plan d'études 2015-2016 | ¡4aîtr¡se universita¡re ès Sciences en b¡ogéosciences | ¡4aster of Sc¡ence (MSc) ¡n B¡ogeosc¡ences

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PIan d'étudesLe Plan d'études en vue de l'obtention de la Maîtrise universitaire en biogéosciences s'articule enquatre groupes de modules respectivement de 48, 12,6 et 54 crédits ECTS:

1. Des modules de tronc commun de 48 crédits ECTS

2. Des modules de spécialisation de 12 crédits ECTS à choix dans l'un des deux domainesproposés :

Spécialisation 1 : Interactions entre Sol et VégétatronSpécialisation 2 : Interactions dans la Géobiosphère

3. Un projet de recherche de 6 crédits ECTS

4. Un mémoire de recherche de 54 crédits ECTS, réalisé, de préférence, en interdisciplinaritéentre les spécialisations.

Principes généraux

1. La Maîtrise universitaire en biogéosciences est une émanation commune des universités deLausanne et de Neuchâtel. Certains enseignements seront donc répartis sur les deux sitesuniversitaires. Sauf exception, les étudiants doivent se déplacer un jour par semaine dans l'autreuniversité que celle de leur immatriculation, en principe pour des cours du tronc commun. La semaineest partagée ainsi : 1 jour de tronc commun à l'Université de Lausanne (le mardi, en principe), 1 jourde tronc commun à l'Université de Neuchâtel (le lundi, en principe), 3 jours de travail personnel, despécialisation ou encore de cours du tronc commun à effectuer sur le terrain,

2. Deux modules de spécialisation de 12 crédits ECTS sont proposés. La spécialisat¡on est à choisir auplus tard à la fin de la 14"'" semaine du semestre d'automne.

3. Tout examen peut être organisé à l'Université de Lausanne ou à l'Université de Neuchâtel. Enprincipe la session d'hiver est organisée à l'Université de Lausanne, la session d'été est organisée àl'Université de Neuchâtel et la session de rattrapage d'automne à I'Université de Lausanne.

Légende du tableau des cours

1. Enseignants : N.N. = enseignant à désigner

2. Semestre : A = semestre d'automne, P = semestre de printemps

3.Typedecours:C=coursexcathedra,E=exerc¡ces,T=terra¡n,TP=travauxprat¡quesenlaboratoire,S = séminaires

4. Heures : les heures réelles totales sont données ; jb = enseignement donné en jour-bloc ; djb = demi-journée-bloc

5. Site : LA = cours donné à Lausanne. NE = cours donné à Neuchåtel. AU = cours donné en un autre lieu(terra¡n). LA ou NE = cours donné sur chaque site (2 groupes en parallèle). LA, NE = cours intégrant desenseignants de LA et de NE, dont les heures sont partagées entre LA et NE (1 seul groupe d'étudiants)

6. Evaluation : le terme ( Prat¡que > désigne un rapport écrit et/ou un exposé oral, indépendamment de lamodalité de travail (travail individuel ou en groupe). Une telle évaluation a lieu dans le cadre du semestre, ellepeut ou non faire l'objet d'une note.

Plan d'études 2015-2016 | MaÎtrise un¡versitaire ès Sciences en biogéosc¡ences I Master of Science (MSc) ¡n B¡ogeosciences

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1 Modules de tronc commun: 48 crédits ECTS

Les enseignements et activités pédagogiques des modules de tronc commun concernent tous lesétudiants inscrits au programme. Le tronc commun s'articule autour de six modules qui forment unenseignement intégré donné par les enseignants impliqués dans l'ensemble du programme, Cetenseignement pose les fondements théoriques des biogéosciences et des approches méthodologiquesassociées. Ce tronc commun comprend des cours ex cathedra, des travaux pratiques, desconférences, des séminaires, des exercices et des excursions. Le programme de chaque année estactualisé avec l'aval du Comité scientifique.Les enseignements s'articulent en trois ensembles de un ou plusieurs modules:

Module Ml ; Acquisitions des bases (6 crédits ECTS)

Module M2 : Méthodes analytiques et techniques (12 crédits ECTS)

Modules M3 à M5 : Enseignements liés à la formation principale en biogéosciences (30crédits ECTS) soit :

Module M3 : Cycles biogéochimiques (12 crédits ECTS)Module M4 : La vie et le sol (12 crédits ECTS)Module M5 : Campus virtuel et cours libres (6 crédits ECTS)

1.1. Module M1 d'acquisitions des bases (6 crédits ECTS)

Deux enseignements sur les quatre proposés doivent obligatoirement être choisis en accord avec lesrecommandations du coordinateur de la Maîtrise universitaire en biogéosciences, et ce, en fonction dela formation initiale de l'étudiant.

Évaluation

Le module est validé et les 6 crédits ECTS sont octroyés lorsque la moyenne des pratiques portant surles deux cours inscrits au sein du module est égale ou supérieure à 4. Attention ce module doitobligatoirement être validé au plus tard en fin du semestre 2. Il constitue un préalable à l'inscriptionen semestre 3 conformément au règlement d'études de la Maîtrise universitaire en biogéosciences.

Coordinateurs : Prof. P. Junier. UNINE et Prof. T Vennemann, UNILM1 Acquisitions des bases 6 ECTS

Cours Enseignantsresponsables Sem Type

Heures Evaluation ECTS Site(s)Ecologie et écosystèmesBiologie 1

Rasmann, Mitchell A c10 djb Pratique 3 NE

MicrobiologieBioloqie 2 Junier, Bindschedler A c

10 djb Pratiq ue 3 NE

Géologie de la surfaceGéolooie 1

Verrecchia,NN IMA Verrecchia) A c

10 djb Pratique 3 LA

Géochimie de la surfaceGéoloqie 2

Vennemann,Spanqenberq A c

10 dib Pratiq ue 3 LA

Examen du M1 : Moyenne pondérée par les ECTS des deux pratiques cho¡sies

Plan d'études 2015-2016 | Maîtrise univers¡taire ès Sc¡ences en biogéosciences I Master of Sc¡ence (MSc) in B¡ogeosciences

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-5-1.2. Module M2 de concepts et méthodes (12 crédits ECTS)

Ce module vise à fournir les techniques de base nécessaires pour l'acquisition et le traitement dedonnées de terrain ou de laboratoire. Les enseignements de ce module sont divers. Ils peuvent portersur des techniques descriptives de terrain, des méthodes analytiques de laboratoire, ou encore surdes aspects d'analyse quantitative. Seul un cours est au choix car il dépend de la formation initiale enBaccalauréat universitaire de l'étudiant (TP Techniques d'écologie moléculaire ou TP Techniquesgéochimiques).

Évaluation

Le module est validé et les 12 crédits ECTS sont octroyés lorsque la moyenne des notes pondéréespar le nombre de crédits ECTS est égale ou supérieure à 4,

M2 Méthodes analytiques et techniques 12 ECTS

Cours Ense¡gnantsresponsables Sem. Type

Heures Evaluation ECTS S¡te(s)

TP Description des sols etanalyses pédologiques Rasmann, Verrecchia A TP

18 dj Prat¡que 6 LA, NE

TP Analyses quant¡tatives desdonnées Verrecchia, Mitchell P

TP6 dih Pratique 2 LA, NE

Examen du M2 : Moyenne pondérée par les ECTS des pratiques

1.3. Modules M3 à M5 d'ense¡gnements liés à la formation pr¡nc¡paleen b¡ogéosc¡ences (3O crédits ECTS)

Les enseignements de cet ensemble de modules forment le cæur commun de la Maîtrise universitaireen biogéosciences. Ils reposent sur des cours intégrés, des séances de Campus Virtuel et des courslibres.

Évaluation

L'enseignement principal est validé et les 30 crédits ECTS sont octroyés lorsque la moyenne (selon ladescription des examens de chaque module ci-dessous) des évaluations de chacun des modules estégale ou supérieure à 4.

Coordinateur : Prof. T. Vennemann, UNILM3 Cycles biogéochimiques 12 ECTS

Cours Enseignantsresoonsables

TypeHeuresSem. Evaluat¡on ECTS Site(s)

Géochimie organique et grandscycles élémentaires

Verrecchia,Föllm¡,NN (MA Verrecchia),Spangenberg,Vennemann

A C,E60 Examen 6 LA

Isotopes stables comme traceursenvironnementa ux Vennemann P

csjb 3 LA

ExamenPeña P

C,E30

Environmental biogeochemistryCours donné en Anolais

Plan d'études 2015-2016 | Maîtr¡se universitaire ès Sc¡ences en biogéosciences I Master of Science (MSc) in Biogeosc¡ences

3 LA

Examen du M3 : 2 écrits de 2 heures

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Coordinateur : Dr C. Le Bavon. UNINE

M4 La vie et le sol 12 ECTS

Cours EnseignantsresDonsables

TypeHeuresSem. Evaluat¡on ECTS Site(s)

Microbiologie desenv¡ronnements naturels

J unier,Bindsched ler A c,s

9 djbExamen

3 NE

Les grands sols du monde Verrecchia,Le Bayon, Mitchell A c

s djb 3 I.A, NE

Biologie du sol Mitchell PC,S18 2 NE

ExamenFormes d'humus et ingénieurs del'écosystème Le Bayon P

c,s1B 2 NE

TP Biologie du sol * ouTP Formes d'humus *

Mitchell, Le BayonLe Bayon

TP20 Prat¡que 2P NE

Examen du M4 : 2 écrits de 2 heures et une pratique. La moyenne du module est pondérée par le nombre deECTS,

* Un des deux TP à choix. Max 12 étudiants pour le TP Formes d'humus.

M5 Campus virtuel, ense¡gnements à choix 6 ECTS

Cours Ense¡gnantsresponsables Sem Type

Heures Evaluat¡on ECTS Site(s)EXE Campus virtuel < Do ItYour Soil > - Module de base Le Bayon A E Pratique 2 AU

EXE Campus virtuel < Do ItYour Soil > - Module optionnel Le Bayon A E Pratique 1 AU

EXE Campus virtuel << Histoirede la vie > Föllmi A E Pratique 2 AU

Stage Franco-Suisse * Mitchell A C, S, TP4tu Pratique 2 AU

EXC Sols et végétation desAlpesMax¡mum 75 étud¡ants

Vittoz, Rasmann PT

4jb Pratique 2 AU

EXE Séminaires, colloques ouenseignements à choix libres

Selonchoix AU

Examen du M5 : évaluations à crédits

* Le stage franco-suisse est proposé dans le cadre de la de la Fédération de masters franco-suisses enenvironnement. Il comporte des cours et des travaux pratiques donnés par des enseignants de la Maîtriseunivers¡taire en biogéosciences, de l'HEPIA et des Maîtr¡ses des universités partena¡res en France, ainsi que desséminaires. Il se déroule en principe à Frasne (France).

Plan d'études 2015-2016 | Maîtrise un¡versita¡re ès Sciences en biogéosciences I Master of Science (MSc) in Biogeosciences

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-7 -2. Module de spécialisation = 12 crédits ECTS

Dans le module M6 deux spécialisations sont proposées (M6.1 et M6.2), L'étudiant s'inscrit à l'un deces deux modules de spécialisation et suit les 12 crédits ECTS proposés. Les enseignements etactivités pédagogiques du module de spécialisation ont lieu principalement durant le semestre 2.

Spécialisation 1 - Module M6.1 << Interactions entre Sol et Végétation >>

Cette spécialisation traite de questions liées à la compréhension des interrelations fondamentalesentre le sol et les communautés végétales, d'un point de vue tant descriptif que fonctionnel. Lamoitié de la formation se fait sur le terrain, au cours de nombreuses sorties consacrées àl'apprentissage de nouvelles connaissances, mais aussi par l'acquisition de techniques de travail.De solides bases théoriques sont fournies dans le domaine de l'étude de la végétation, del'écologie et de l'anatomie des plantes supérieures.

Spécialisation 2 - Module M6.2 << Interactions dans la Géobiosphère >>

Cette spécialisation s'attache à étudier les interactions dans la géobiosphère (interactions àdiverses échelles du paysage), en incluant certaines reconstitutions paléo-environnementales(paléoécologie). Elle propose l'acquisition de bases fondamentales et le pefectionnement dansl'étude des phénomènes physico-chimiques (méthodes d'études de la géobiosphère) etbiogéochimiques (géomicrobiologie) associés aux eaux et aux sols, et leurs conséquences surl'évolution des écosystèmes qu'ils soient naturels ou influencés par l'homme,

Les deux spécialisations se terminent par un enseignement commun sur le terrain << Analyse dupaysage naturel - cartographie >> permettant aux étudiants de faire la synthèse des notions acquisestant dans les parties communes que dans les spécialisations choisies.

Plan d'études 2015-2016 | Maîtrise un¡versita¡re ès Sciences en biogéosc¡ences I Master of Science (MSc) ¡n B¡ogeosciences

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-8-2.1. Spécialisation 1 - Module M6.1

<< Interactions entre Sol et Végétation >>

Coordinateurs : Prof. S. Rasmann, UNINE et Dr P. Vittoz, UNIL

Évaluation : Le module est validé et les 12 crédits ECTS sont octroyés lorsque la moyenne (selon ladescription des examens du M6.1) des évaluations du module est égale ou supérieure à 4.

M6.1 Spécialisation 1 : Interactions Sol - Végétation 12 ECTS

Cours Ense¡gnantsresponsables Semestre Type

Heures Evaluation ECTS Site(s)Méthodes d'étude de lavéqétation Rasmann P

c15

Phytosociolog¡e et Vittoz Pc2t Examen 2 NEsvnsvstématin ue

EXC Relations sol - végétation Vittoz, Le Bayon PPorta nt

SUTl'exc.

1.5 NE

1.5 AU

EXC Relations sol - végétation Vittoz, Le Bayon PT

6ib Pratique 1 AU

TP Méthodes d'étude de lavéoétation Gillet P

TP5ib Pratique 2 NE

Anatomie fonctionnelle despla ntes Vollenweider P

c18TPsdjEXC 1ib

Prat¡que 2 NE

EXC Analyse du paysagenaturel - cartograph¡e Verrecchia, Vittoz P

Tsjb Prat¡que 2 AU

Examen du M6.1 : L'examen est un examen oral de 45 m¡n. d'une valeur de 5 crédits ECTS. La moyenne dumodule est pondérée par le nombre de ECTS.

2.2. Spécialisat¡on 2 - Module M6.2<< Interact¡ons dans la Géobiosphère >>

Coordinateurs: Prof. P. Junier, UNINE et Prof. E, Verrecchia, UNIL

Evaluation : Le module est validé et les 12 crédits ECTS sont octroyés lorsque la moyenne (selon ladescription des examens du M6.2) des évaluations du module est égale ou supérieure à 4.

M6.2 Spécialisation 2 : Interactions dans la Géobiosphère 12 ECTS

cours Enre

Bio-altérations etbiominéra lisations

Junier, Bindschedler,Verrecchia, P

c6 djb 2 LA, NE

NN Verrecchia)Géomicrobiologie Junier, Bindschedler P

C,S1B

Examen 2 NE

Format¡ons superficielles et Verrecchia,sols, micromorphologie NN (MA Verrecchia) P

C, TP6 djb 2 LA

Paléoécologie Mitchell PC, TP6 d'ib Pratique 2 NE

Microscopie électronique àbalayage (2" année)Val¡dation sans note

NN, Vonlanthen A C, TPs djb Pratique 2 LA

EXC Analyse du paysagenaturel - cartographie Verrecchia, Vittoz P

Tsjb Pratique 2

Examen du M6.2 : L'examen est un examen oral de 45 min. d'une valeur de 6 crédits ECTS. La moyenne dumodule est pondérée par le nombre de ECTS.

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AU

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3. Travail de maîtrise : 60 crédits ECTS

3.1. Projet de recherche - Module Vl7 (6 ECTS)

Dans le module M7, l'étudiant propose, sous forme d'un document de 10 pages maximum, son projetde recherche qui inclura : la problématique du sujet, l'état de I'art sur le sujet, les résultatsescomptés, un calendrier prévisionnel de la réalisation du travail au cours des semestres 3 et 4, laliste des références bibliographiques consultées, et un budget relatif aux coûts (déplacements,analyses, etc.).

M7 Projet de recherche 6 ECTS

Cours Ense¡gnantsresoonsables Sem. Type

Heures Evaluet¡on ECTS Site(s)

Rédaction du projet de mémoire Pratique 6 LA, NE,AUP

Examen du M7 : 1 note sur le projet écrit pondéré par les crédits ECTS de la pratique

3.2. Mémoire de recherche - Module M8 (54 ECTS)

Ce module peut être commencé seulement s¡ tous les modules, à l'exception du module 6 << Campusvirtuel - cours à choix >>, sont validés.

Le dernier module MB est réservé à un travail de recherche personnel permettant l'acquisition de 54crédits ECTS. Le travail de recherche est réalisé en liaison ou non avec le module de spécialisationchoisi. En effet, les sujets transdisciplinaires entre laboratoires sont fortement encouragés. Des sujetsen collaboration avec les laboratoires impliqués dans le cadre de la Fédération de masters franco-suisses en environnement sont également plus que bienvenus. La procédure régissant la réalisationdu travail de recherche figure dans les directives sur le mémoire de recherche en biogéosciences.

Mode d'évaluation du MB : 1 note sur le mémoire de recherche

***Conseil de Faculté du 12 mars 2015

François BussyDoyen (FGSE UNIL)

Conseil de Faculté du 17 mars 2015

(. ft",)Bruno ColboisDoyen (FS UNINE)

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