Liste des analyses effectuées au laboratoire Ref : MS-ANA-MO-053 Version : 06 Applicable le : 30-04-2018 La version informatique fait foi Page 1 sur 32 1- OBJECTIF Ce mode opératoire décrit les modalités de traitement et de conservation pré analytique des échantillons analysés par le LBM-MS BIO-AUSTRAL. 2- DOMAINE D’APPLICATION ET RESPONSABILITES Ce mode opératoire s’applique au personnel prenant connaissance de la revue de contrat (secrétaire, technicien et biologiste). Les échantillons proviennent du laboratoire ou de préleveurs externes (cabinets infirmiers, établissement de soins…). 3- DOCUMENTS DE REFERENCE Fiches techniques des automates de réalisation des analyses REMIC et ANNOFEL Bactériologie médicale F.DENIS 4- DESCRIPTION N.B1 : Toutes les analyses effectuées sur les tubes rouges peuvent également être réalisées sur les tubes jaunes sauf mention contraire indiquée ci-après N.B2 : Les analyses URGENTES doivent être acheminées immédiatement (appel du coursier) N.B3 : Pour les analyses en vert, si TT Biotine (Vit B8, B7 et Vit H)*, le patient doit faire sont prélèvement à distance (>8H) N.B4 : Prélèvement à visée bactériologique, virologique, myco et parasitologique: Tableau spécifique en fin de document N.B5 : Pour les analyses à visée bactériologique, si prélèvement différé, une fiche de préconisation est remise systématiquement au patient. N.B6 : La mention plasma ou sérum implique que les prélèvements soient décantés. N.B7 : Le délai pré-analytique est le délai maximal de conservation du sang total avant analyse ou avant centrifugation
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Liste des analyses effectuées au laboratoire
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1- OBJECTIF
Ce mode opératoire décrit les modalités de traitement et de conservation pré analytique des échantillons analysés par le LBM-MS BIO-AUSTRAL.
2- DOMAINE D’APPLICATION ET RESPONSABILITES
Ce mode opératoire s’applique au personnel prenant connaissance de la revue de contrat (secrétaire, technicien et biologiste). Les échantillonsproviennent du laboratoire ou de préleveurs externes (cabinets infirmiers, établissement de soins…).
3- DOCUMENTS DE REFERENCE
Fiches techniques des automates de réalisation des analysesREMIC et ANNOFELBactériologie médicale F.DENIS
4- DESCRIPTION
N.B1 : Toutes les analyses effectuées sur les tubes rouges peuvent également être réalisées sur les tubes jaunes sauf mention contraire indiquée ci-aprèsN.B2 : Les analyses URGENTES doivent être acheminées immédiatement (appel du coursier)N.B3 : Pour les analyses en vert, si TT Biotine (Vit B8, B7 et Vit H)*, le patient doit faire sont prélèvement à distance (>8H)N.B4 : Prélèvement à visée bactériologique, virologique, myco et parasitologique: Tableau spécifique en fin de documentN.B5 : Pour les analyses à visée bactériologique, si prélèvement différé, une fiche de préconisation est remise systématiquement au patient.N.B6 : La mention plasma ou sérum implique que les prélèvements soient décantés.N.B7 : Le délai pré-analytique est le délai maximal de conservation du sang total avant analyse ou avant centrifugation
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ANALYSE
ECHANTILLON(volume) PRETRAITEMENT / CONSERVATION
METHODE
DUREE DESTABILITE
Sang totalT° ambiante
DELAI DERAJOUTMatrice de
référenceMatrice
alternative Exigences pré-analytiques Prétraitement
25 OH VIT D2+D3 Voir VITAMINE D
A
ACE 1 mL 1 mL Fumeur ? Sérum réfrigéré ECL (Sandwich) 8HSi SRL :6 mois
Test direct à l’antiglobuline engel filtration (Méthode
immunologiqued'hémagglutination) BIORAD
8HDans lajournée
CORTISOL 1mL 1mL
Si aucune précision : 6H-10HNoter heure de prélèvementTest de freinage (Dectancyl àminuit)
Sérum réfrigéré (4 jours) ECL (compétition)8H
Pas de RajoutPas de Rajout
COTININE Urines échantillon -
Si précipités visiblescentrifuger ou laisser sédimenter
afin avoir un surnageant clairpour le test
48h à 2-8°C. Au-delà -20°C
Immunochromatographie sursupport solide
(test immunologique parcompétition)
8HVoir ci-contreHN (voir SIL)
Pas de Rajout
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ANALYSE
ECHANTILLON(volume) PRETRAITEMENT / CONSERVATION
METHODEDELAI
Sang totalT° ambiante
DELAIRajoutMatrice de
référenceMatrice
alternative Exigences pré-analytiques Prétraitement
CPK = CREATINE KINASE 1mL 1mL
Exempt d’hémolyseSerum :
2j à TA ; 7j à 2-8°C ;4 semaines à -20°C
Spectrophotométried’absorption
(CK NAK IFCC, DGKC, SCE,SFBC)
8HDans lajournée
CREATININE 1mL 1mLPlasma :
7j à TA ou 7j à 2-8°C ou3 mois à -20°C
Spectrophotométried’absorption
(Enzymatique, colorimétriquePAP)
8HDans lajournée
CREATININE URINAIRE
- Echantillon à tout momentde la journée si associée à lamicroalbuminurie ouprotéinurie pour le calculRAC ou RPC (Flacon sansadditif)- Urines de 24h si prescrit(Flacon gradué 2L)- 1ère miction si prescrit suréchantillon et pas de calculRAC ou RPC associé (flaconsans additif)
Urines 24h : Conservation à4°C pendant tout le recueilFiche préconisation patient
(24H)
2j à TA6j à 2-8°C
6 mois à -20°C
Spectrophotométried’absorption
(Enzymatique, colorimétriquePAP)
8H 2j
CRP 1mL 1mL 1mL 1mL -11j à TA
2 mois à 2-8°3 ans à -20°
Spectrophotométried’absorption
(Immunoturbidimétrie latex)8H
Dans lajournée
CULOT URINAIREUrine échantillon
(Flacon stérile ou TubeBorate)
Fiche de préconisation ECBU< 4H TA ou <12H 4°C
< 48H TA sur tube borateLecture optique 4H 4H
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ANALYSE
ECHANTILLON(volume) PRETRAITEMENT / CONSERVATION
METHODEDELAI
Sang totalT° ambiante
DELAIRajoutMatrice de
référenceMatrice
alternativeExigences pré-
analytiques Prétraitement
D
DDIMERES 1mL
URGENCE :Patient et médecin
joignablePrévenir lelaboratoireexécutant
Pose du garrot <1min
Remplissagecorrect/accepté 80%
Acheminement immédiat
Sang total : recommandé jusqu’à 24hentre 15 et 25°C, acceptable jusqu’à 24h
entre 4-8°C (GFHT)
Plasma : si échantillons centrifugés etdécantés dans les deux heures suivant le
prélèvement8h entre 15 et 25°C (fiche STAGO) et
24 mois à -20°C (GFHT)
Spectrophotométried’absorption (Immuno-
turbidimétrie)STA
En fonction sangtotal ou plasma(voir ci-contre)
Rajout : voirBiologiste
DENSITE URINAIRE Voir BANDELETTE URINAIRE
DEPAKINE Voir ACIDE VALPROIQUE
DIGOXINE1mL (PASde GEL) -
A jeun avant la prisedu matin
Fiche renseignementmédicament
Sérum réfrigéréSpectrophotométrie
d’absorption(KIMS)
8H Pas de Rajout
DIHYDAN Voir PHENYTOINE
EEAL
(exploration d’anomalielipidique)
Voir C-HDL
ELECTROPHORESE DEL’HEMOGLOBINEMar et Ven (si nb ≥ 4)
2mL - Origine ethniqueSang total réfrigéré
7j à 2-8°C, au-delà -20°CElectrophorèse capillaire
Minicap sebia8H Voir ci-contre
ELECTROPHORESE DESPROTEINES SERIQUES
Lun au ven1mL 1mL
A distance repasExempt d’hémolyse
Vendredi, samedi et veille j férié,centrifuger et décanter sur site.Si tube gel: décanter sur site
alternative Exigences pré-analytiques Prétraitement
T
TAUX DE REABSORPTIONPHOSPHORE CALCULE
1 tube HEP et 1 Urine échantillon Formule TRP (en %) = [1-(Phos U x Créat sang)/ (Phos sang x Créat U)] x100
T3L Voir FT3
T4L Voir FT4
TCA(CEPHASCREEN)
1mLPose du garrot <1 min
Remplissage recommandé 90%(trait) / accepté 80%
Sang totalPlasma : 15j à -
20°C
Temps de coagulation à 37° aveccéphaline et activateur
(Mesure chronométrique)STA
4H Pas de rajout*
REMARQUE TCA * Si allongement anormal du TCA non connu, non lié à un traitement anticoagulant : Contrôle sur un nouveau plvt et/ou dosagefacteurs VIII, IX, XI et éventuellement XII et recherche anti-FVIII ou FIX si suspicion d’hémophilie acquise si congélation < 4H.
TEGRETOL Voir CARBAMAZEPINE
TESTOSTERONE 1mL 1mLA distance des repas et le
matinSérum réfrigéré ECL (compétition) 8H Pas de Rajout
alternative Exigences pré-analytiques Prétraitement
TP/INR 1 mLPose du garrot <1 min
Remplissage recommandé90% (trait)/ accepté 80%
Sang totalPlasma : 15j à -
20°C
Temps de coagulation à 37° avecthromboplastine calcique(Mesure chronométrique)
STA
6H Pas de rajout*
REMARQUE TP * Si allongement anormal du TQ non connu, non lié à un traitement anticoagulant : Dosage du fibrinogène et des facteurs II, V, VII et X sicongélation < 4H.
TPHA Voir SYPHILIS
TRANSAMINASESASAT / ALAT
1mL 1mL 1 mL -
TGP : Exemptd’hémolyse
Plasma :24h à TA (3j pour
TGP),7j à 2-8°C
Spectrophotométrie d'absorption(IFCC, avec phosphate de pyridoxal)
8HDélai de rajout :dans la journée
TRANSFERRINE 1mL 1mL -Plasma :
8j à TA ou 2-8°C6 mois à -20°C
Spectrophotométrie d'absorption(Turbidimétrie)
8HDélai de rajout :dans la journée
TRANSFERRINECARBOXY
DEFICIENTEVoir CDT
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ANALYSE
ECHANTILLON(volume) PRETRAITEMENT / CONSERVATION
METHODE
DELAISang total
T°ambiante
DELAIRajoutMatrice de
référenceMatrice
alternative Exigences pré-analytiques Prétraitement
TRIGLYCERIDES 1mL 1mL A jeun de 12h
Plasma :2j entre 20-25°C, 15j à +4°C et 3
mois à -20°CSérum :
2j entre 20-25°C, 10j à +4°C et 3mois à -20°C
Spectrophotométried'absorption(GPO/PAP)
8H
Délai derajout :dans lajournée
TROPONINE T HS 1mL 1mL URGENCE :Patient et médecin joignable
- Urine de 24h si prescrit(Flacon gradué 2L)- 1ere urines échantillon (Flaconsans additif)
Urines de 24h de préférenceFiche de préconisation (24H)
2j à TA7j à 2-8°C
1 mois à -20°C
Spectrophotométried'absorption
(Urease/GLDH)
<4Haprès latotalité
durecueil
Délai derajout :voir cicontre
URICEMIE Voir ACIDE URIQUE
UROBILINOGENE URINAIRE Voir BANDELETTE URINAIRE
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ANALYSE (CODE)
ECHANTILLON(volume) PRETRAITEMENT / CONSERVATION
METHODE
DELAISang total
T°ambiante
DELAIRajoutMatrice de
référenceMatrice
alternative Exigences pré-analytiques Prétraitement
V
VDRL Voir SYPHILIS
VIH Voir HIV
VITAMINE B9 Voir ACIDE FOLIQUE
VITAMINE B12 1mL 1mL
A jeunExempt d’hémolyseAbri de la lumière.
Si délai >4H avant analyse :- Centrifuger et décanter sursite.- Sérum réfrigéré- CONGELER les samedis etveilles de jours fériés
ECL (compétition) 8HPas deRajout
VITAMINE D TOTALE 1mL 1mL A jeunSérum réfrigéré
Exempt d’hémolyse etlactescence
ECL (compétition)8H
Pas deRajout
HN saufcertainesindicatio
ns*VITESSE DE SEDIMENTATION Vol min 2mL -
Sang Total :4h à TA ou 24h à 2-8°C
Mesure par sédimentationVSmatic 200 DIESSE
Voir ci-contre
Pas derajout
Remarque : Selon le contexte et l’urgence de la situation, le biologiste peut déroger à la règle de ces recommandations et décider d’effectuer les analyses.L’interprétation du bilan lui incombe et se fera en fonction de la situation (enregistrement éventuelle d’une NCK et Dérogation).
* Sont considérés UNIQUEMENT comme pièce d’identité : CNI, Passeport, Livret de famille et carte de séjour.
* Sang total à Température Ambiante.
* VDT uniquement remboursée si suspicion rachitisme, ostéomalacie, 3mois post transplantation, chir bariatrique, chutes répétées et certains médicaments (RCP).
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Prélèvements à visée bactériologique, virologique, mycologique et parasitologique
ANALYSES ECHANTILLON EXIGENCES PRE-ANALYTIQUESDELAI DE
CONSERVATIONAVANT ANALYSE
METHODE
URINES
ECBU*
- Flacon stérileOu
- Collecteur d’urineadhésif pédiatrique
stérileOU
- Tube borate(Vol mini : trait
indiqué surl'étiquette mention
Min)
ECBU classique :Fiche de préconisation patientDans la mesure du possible : à distance de 2 heures de la miction précédente
Pose d’un collecteur d’urine chez un bébé :- Nettoyer la peau avec la lingette (d’avant en arrière pour les filles)- Appliquer soigneusement la partie adhésive de la poche pour garantir une bonneadhérence.- Retirer la poche au bout de 30 minutes ou la changer si absence d’urines.Cas d’une urétérostomie :
- Nettoyer soigneusement la stomie puis placer le collecteur stérile et procédercomme pour les bébés.
Cas d’une sonde à demeure (SAD):
- Clamper la SAD au dessus de la jonction sonde/collecteur, faire boire 1 ou 2 verred’eau et attendre.- Nettoyer la jonction sonde/collecteur avec une lingette antiseptique.
- Déconnecter la sonde du collecteur, placer le flacon stérile sous l’orifice etdéclamper, pour obtenir une quantité suffisante d’urine.- Reclamper, fermer le flacon, reconnecter le collecteur, désinfecter avec une lingettele point de jonction, puis déclamper la pince.
Remplir fiche de renseignement ECBU
<4h TA
<12h à 4°C
48h TA sur milieu deconservation
(Acide Borique)
Automate ouLecture optique etCulture en milieu
solide
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ANALYSES ECHANTILLON EXIGENCES PRE-ANALYTIQUESDELAI DE CONSERVATION
AVANT ANALYSEMETHODE
URINES
CHLAMYDIAE/GONOCOQUE-Recherche
- Flacon stérile- Rétention urinaire : 2h- Recueillir le 1er jet d’urines- 15 jours après arrêt du traitement
- Transférer 1 ml dans lemilieu de transport dans les 4h- Conservation :24H à 2-8°C5j entre 2-8°C sur milieu detransport
PCR (Sous traitée)
MYCOPLASME GENITALLIUMRecherche
- Flacon stérile- Rétention urinaire : 3h- Recueillir le 1er jet d’urines- 5 jours après arrêt du traitement
- Transvaser les urines puresdans un tube stérile- Conservation : <24h à 2-8°C
PCR (Sous traitée)
MYCOPLASMESUROGENITAUXCulture +/- ATB
- Flacon stérile- Rétention urinaire : 3h
- Recueillir le 1er jet d’urines- 5 jours après arrêt du traitement
<2h TA<5h en milieu de transport à
l’abri de la lumière TA48h en milieu de transport àl’abri de la lumière 2-8°C
Culture en milieu solideet/ou liquide
ATB sur milieu liquide
BILHARZIOSE URINAIRERecherche de schistosomes dans
les urines- Flacon stérile Fiche de préconisation Bilharziose <4h TA Lecture optique
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ANALYSES ECHANTILLON EXIGENCES PRE-ANALYTIQUESDELAI DE CONSERVATION
AVANT ANALYSEMETHODE
SELLES (Un échantillon suffit, ne pas remplir le pot)
ADENOVIRUSFlacon stérile
CoucheFiche de préconisation patientFiche de renseignement
<6h TA<72H à 4°C
Immunochromatographiesur support solide
ANGUILLULEFlacon stérile
CoucheFiche de préconisation patientFiche de renseignement
<4h TAExamen direct et
Concentration(Baerman)
COPROCULTUREFlacon stérile
CoucheFiche de préconisation patientFiche de renseignement
<4h TA<12h à 4°C
Examen direct,coloration de Gram etCulture (milieu solide)
CRYPTOSPORIDIESFlacon stérile
CoucheFiche de préconisation patientFiche de renseignement
<4h TASinon 4°C Coloration (Sous-traitée)
OXYURE - Recherche Voir SCOTCH TEST
PARASITOLOGIE DESSELLES
Récipient propreFiche de préconisation patientFiche de renseignement
<4h TAExamen direct et
Concentration (deuxméthodes)
ROTAVIRUSFlacon stérile
CoucheFiche de préconisation patientFiche de renseignement
<6h TA<72H à 4°C
Immunochromatographiesur support solide
SCOTCH TEST Lame + ScotchA effectuer au laboratoire au lever avant la toilette et lespremières selles
Lecture immédiate Lecture optique
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ANALYSES ECHANTILLON EXIGENCES PRE-ANALYTIQUESDELAI DE CONSERVATION
AVANT ANALYSEMETHODE
AUTRES
BACTERIE NOMMEMENTDESIGNEE
Ecouvillon sec ouEcouvillon detransport ou
Flacon stérile(Urines/Selles)
Préciser la bactérie recherchée etLe site de prélèvement.
- Ecouvillon: <2h TA24H TA (mil transports)
- Urines: <4h TA<12h à 4°C
48h TA sur milieu borate(Gonocoques)
- Selles: < 4H (TA)
Culture sur milieu solide
Candida albicans DANS LES SELLES Voir BACTERIE NOMMEMENT DESIGNEE
Flacon stérileURGENT : Ne pas refuser le prélèvement (voir Bio)Remplir Fiche de renseignement
<4h TAExamen direct, coloration
de Gram et Culture(milieu solide)
PRELEVEMENT MYCOLOGIQUERécipient propre(Boite de pétri)
A distance du traitement- Ongle : 3 mois après traitement- Peau/cheveux/poils : 1 semaine après arrêt traitement
24h TAExamen direct, et Culture
(milieu solide)
PRELEVEMENT URETHRALGermes banauxMycoplasmes
Ecouvillon sec(Metal pr MYP)
Ecouvillon surmilieu de transport
ET 1et jet urines(Chlamydiae +/-mycoplasmes)
Rétention urinaire de 2h avant le prélèvement, NIéliminer les sécrétions, NI se laver.Remplir Fiche de renseignement
Ecouvillons : <2h TA24H TA Mil transport
Pour mycoplasme urine ouécouvillon :
<2h TA<5h en milieu de transport à
l’abri de la lumière TA48h en milieu de transport àl’abri de la lumière 2-8°C
Gono/Chlamydiae/M.genitalliumvoir urines
Examen direct, colorationde Gram et Culture
(milieu solide et liquide)
PCR (sous-traité)
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ANALYSES ECHANTILLON EXIGENCES PRE-ANALYTIQUESDELAI DE CONSERVATION
AVANT ANALYSEMETHODE
PRELEVEMENT VAGINAL :Germes banaux
Chlamydiae/Mycoplasmes
Ecouvillon sec(Tige bois +/- Metal
pr MYP)
Ecouvillon sur milieude transport
Sauf indication médicale, ce prélèvement NE doit PASêtre fait :- Pendant la période des règles,- Si vous avez mis un ovule depuis moins de 7 jours
(48h pour Chlamydiae).Le jour du prélèvement, NE PAS faire de toiletteinterne, avant de venir au laboratoire (toilette externetolérée).Remplir Fiche de renseignement PV
<2h TA (ecouv rouge)24h TA (ecouv gel)
<5h TA (ecouv orange)Mil trans MYP :Abri lum et 48h 2-8°CAbri lum et <5h TA
Mil trans Chlam/Gono :5J à 2-8°C ; casserl’écouvillon dans le mil ;si PV fait sur liq amies(bouchon violet) transférer200µl dans le mil detransport PCRMil trans M.génitallium =liq amies
Examen direct, coloration deGram et Culture
(milieu solide et liquide)
PCR (sous-traité)
PUSEcouvillon ou flacon
stérile ou seringuebouchée
Ecouvillon sec / flacon / seringue (sans aiguille)Ecouvillon sur milieu de transport
Remplir la fiche de renseignement
<2h TA
24h TA (mil transport)Examen direct, coloration de
Gram et Culture
SPERMESeule la spermoculture est réalisée au
labo ; pour les spermogrammes orienterle patient en PMA au GHSR ou voir
biologiste
- Flacon stérileFiche de préconisation patient
Fiche de renseignement
<4h TAMil trans MYP :Abri lum et 48h 2-8°CAbri lum et <5h TAMil trans Chlam :5J à 2-8°C
(200µL dans mil detransport PCR)
Examen direct, coloration deGram et Culture en milieu
solide et liquide (mycoplasme)
PCR (sous-traité)
STREPTO B dans PV Voir BACTERIE NOMMEMENT DESIGNEE
Si délais ou conservation des prélèvement microbiologiques non conforme => consulter le doc joint « critère d’acceptabilité en microbiologie ».Attention : ne pas refuser un prélèvement sans en informer le biologiste (Ne pas oublier d'enregistrer une NCK et dérogation si besoin).
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*Urines : Ordre de remplissage des tubes si besoin : tubes chimie AVANT tube borate.