1999-2010 1999-2010 La cytométrie en flux au La cytométrie en flux au LEMAR LEMAR État des lieux et État des lieux et prospectives prospectives 10e0 10e1 10e2 10e3 10e4 R ed Fluorescence (R ED-HLog) 75 563 375 188 0 Count 10e0 10e1 10e2 10e3 10e4 R ed Fluorescence (R ED-HLog) 75 563 375 188 0 Count "La collecte des données et l’expérimentation ne peuvent se faire que si les recherches s’inscrivent dans le long terme avec du personnel qualifié". “Comme les 3 autres outils de l’INEE (écotrons, observatoires, base de donnée), les plateformes d’analyse sont au coeur d’une dynamique de recherche pluridisciplinaire et partenariale. «Compte rendu du Colloque de prospective de l’Institut Écologie et Environnement du CNRS » (Rennes, 12-13 mai 2009) Natures Sciences Sociétés 17, 412-416 (2009)
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1999-2010 La cytométrie en flux au LEMAR État des lieux et prospectives
1999-2010 La cytométrie en flux au LEMAR État des lieux et prospectives. " La collecte des données et l’expérimentation ne peuvent se faire que si les recherches s’inscrivent dans le long terme avec du personnel qualifié " . - PowerPoint PPT Presentation
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1999-20101999-2010La cytométrie en flux au La cytométrie en flux au
LEMAR LEMAR État des lieux et prospectivesÉtat des lieux et prospectives
• Laboratoire génétique et pathologie, Ifremer La Tremblade : interaction pathogènes / espèces aquacoles exploitées (Tristan Renault)
• plateforme régionale de cytométrie en flux (PRECYM) centre d’océanologie de Marseille : microbiologie, marine ou non, bactériologie. (Gérald Gregori)
La cytométrie en flux : Un outil au cœur des problématiques
du laboratoire
Biologie moléculaire
Microscopieconfocale
BiologieBiologieBiogéochimie des OcéansBiogéochimie des Océans
Changement globalChangement global
Étude du Étude du ""biomebiome"" littorallittoral
Molécule - gèneCellule
Individu
Population
Écosystème CouplageCouplage
Cytométrie en fluxCytométrie en flux
Un acteur majeur de l’approche intégrative : du gène à l’écosystème
Quelques exemples de paramètresQuelques exemples de paramètres
• Activité oxydative intracellulaire• Dénombrement de particules virales
• Expérience de grazing (Oxyrrhis / Dunaliella)
• Comptage de cocolithophoridés
Activité oxydative intracellulaire (AOI)
increasing AOI
1 00 1 01 1 02 1 03 1 04
FL
1-H
10
01
01
10
21
03
10
4
S S C -H
R 1
R 2
R 3
+ F S S W , t = 6 0 m in(a )
granulocytes hyalinocytes agranulocytes
Fluorochrome = DCFH-DA (fluorescence verte -FL1)
Projet OXYGENE : Analyses transcriptionnelle et fonctionnelle de l’impact de la
reproduction sur les équilibres énergétique et oxydatif de l’huître creuse Crassostrea gigas.
Axe 1, Gis EUROPÔLE MER, GÉNOMIQUE ET CHIMIE BLEUE EXPLORATION ET VALORISATION DES GÉNOMES MARINS
infecte une microalgue eukaryote Micromonas pusilla.
(Anne-Claire Baudoux) 12/11/2009Marquage Sybr
virus (en rouge)
Bruit de fond
Bactéries
Virus Mpv
Projet d’Anne Claire-Baudoux :Implication des virus dans la biogéochimie des océans
Grazing: Oxyrrhis / Dunaliella
Oxyrrhis sp.
Dunaliella salina
Post doc: Sabine Schultes
Schultes et al. (2010). Recycling and feedback in Si(OH)4 dynamics when protozoan grazers feed on diatoms. Protist 161, 288-303.