Web viewBaik hewan maupun tumbuhan juga mempunyai variasai yang tampak antara lain dalam bentuk, ... Tabel dendogram menunjukan kedekatan kekerabatan dari suatu spesies,

LAPORAN PRAKTIKUM GENETIKA

KEANEKARAGAMAN PADA TUMBUHAN

Diajukan untuk Memenuhi Salah Satu Tugas Mata Kuliah Genetika

Semester Genap Tahun Ajaran 2009/2010

Disusun oleh:

Anissa Paramita 0700594Anti Yunita 0700960Cucu Nurmalasari 0700410Febi Ryza Rubbani 0706616Nisa Permata A.K 0704368

Salinan * 0706582

Kelas BKelompok 3

JURUSAN PENDIDIKAN BIOLOGI

FAKULTAS PENDIDIKAN MATEMATIKA DAN ILMU PENGETAHUAN ALAM

UNIVERSITAS PENDIDIKAN INDONESIA

2010

* editor

PENDAHULUAN

A. Dasar Teori

“tidak ada dua individu yang sama persis”. Hal ini disebabkan oleh adanya variasi

organisme dari spesies yang sama atau keanekaragaman spesiesnya. Lingkungan atau

faktor eksternal seperti makanan, suhu, cahaya, kelembaban, pH, curah hujan dan faktor-

faktor lainnya bersama-sama faktor menurun yang diwariska dari kedua induknya sangat

berpengaruh terhadap fenotif suatu individu. Dengan demikian fenotif suatu individu

merupakan interaksi antara genotip dengan lingkungan. Baik hewan maupun tumbuhan

juga mempunyai variasai yang tampak antara lain dalam bentuk, ukuran tubuh, warna

dan ciri khasnya.

B. Latar Belakang

Karena adanya variasi organisme dari spesies yang sama atau disebut juga

keanekaragaman spesies, maka tidak akan pernah ada dua individu yang sama persis. Hal

ini diantaranya dapat disebabkan oleh lingkungan atau faktor eksternal seperti cahaya

matahari, kelembaban, suhu, makanan, curah hujan, dan faktor-faktor lainnya bersama-

sama faktor menurun yang diwariskan dari kedua induknya sangat berpengaruh terhadap

fenotip suatu individu. Dengan demikian maka fenotip suatu individu merupakan hasil

interaksi antara genotip dengan lingkungan. Baik hewan maupun tumbuhan juga

memiliki variasi yang tampak antara lain dalam bentuk, ukuran tubuh, warna dan ciri

khas lainnya. Maka dari itu kami selaku mahasiswa pendidikan biologi yang mengontrak

mata kuliah genetika ingin mempelajari keanekaragaman dalam species dengan jalan

melakukan praktikum keanekaragaman tumbuhan.

C. Prinsip kerja

Prinsip kerja dari praktikum ini adalah, melihat variasi sifat tertentu dari satu

spesies yang sama, bahwa dalam satu spesies yang sama pun terdapat perbedaan, dan

membuat dendogram sebagai hasil perhitungan dari indeks kesamaan. Kami mencari

persamaan dan perbedaan dari spesies tertentu yang kami tentukan sendiri, dalam

praktikum ini kami memilih species Aglaonema sp. Pertama-tama kami kumpulkan dulu

tanaman Aglaonema sp sebanyak lima tanaman dari tempat yang berbeda dan juga dari

penampakan luarnya sudah tampak adanya sedikit perbedaan. Kemudian kami tentukan

sifat-sifat apa saja yang akan kami amati sebanyak sepuluh sifat. Barulah setelah itu kami

mengamati kelima Aglaonema sp tersebut dengan berpedoman pada sifat-sifat yang akan

diamati yang sudah kami tentukan sebelumnya. Variasi-variasi sifat yang kami temukan

(berupa persamaan dan perbedaan) kami catat dalam tabel pengamatan yang sudah

disediakan di jurnal praktikum genetika. Hasil dalam tabel tersebut lalu kami olah

kedalam indeks kesamaan, Indeks kesamaan inilah yang nantinya kami buat menjadi

dendogram yang akan menunjukaan sejauh mana kesamaan antar individu dalam satu

spesies.

D. Tujuan Praktikum

Setelah selesai melakukan praktikum keanekaragaman tumbuhan, mahasiswa dapat:

1. Mendeskripsikan hasil pengamatannya tentang berbagai variasi pada tumbuhan,

2. Membuat dendogram berdasarkan indeks kesamaan Sorensen,

3. Menentukan sejauh mana persamaan den perbedaan pada individu-individu yang

diamati,

4. Menyimpulkan, dan mengkomunikasikan hasil pengamatannya.

METODE KERJA

A. Alat dan Bahan

Aglaonema sp.

Mistar

Dan alat tulis

B. Cara Kerja:

Untuk melihat seberapa dekat hubungan antara speseis Aglaonema yang satu dengan

yang lainnya dapat dibantu dengan membuat Dendrogram dari data-data table hasil

pengamatan variasi sifat yang telah dilakukan. Yaitu dengan cara sebagai berikut:

a. Membuat tabel persamaan dan perbedaan karakter pada setiap tumbuhan. Angka 1

menunjukan karakter tersebut dimiliki suatu individu yang dibandingkan, sedangkan

angka 0 menunjukan karakter-karakter tersebut tidak dimiliki oleh suatu individu

tersebut.

b. Menjumlahkan karakter-karakter pada masing-masing spesies.

c. Menjumlahkan karakter-karakter yang sama atau ada pada kedua spesies yang

diamati. Menbandingkan (Sp 1 dengan Sp 2, Sp1-Sp3,Sp1-Sp4,Sp1-Sp4,Sp1-

Sp5,Sp2-Sp3,Sp2-Sp4,Sp2-Sp5,Sp3-Sp4 dan seterusnya).

d. Menghitung nilai indeks kesamaan untuk masing-masing menggunakan rumus:

S = 2C X100%

A+B

e. Selanjutnya menyusun data yang telah dihitung indeks kesamaannya menjadi diagram

matrik.

f. Memilih nilai indeks yang terbersar dari diagram matrik tersebut.

1. Mengelompokan nilai indeks yang terbesar

2. Menyusun kelompok spesies yang tersisa.

3. Membuat matrik baru berdasarkan kelompok baru.

4. Menghitung nilai indeks untuk membandingkan kelompok yang baru.

5. Memasukan data-data yang baru ke dalam matriks.

g. Mengulangi langkah ke enam sampai tidak ada lagi spesies yang belum berkelompok.

h. Membuat dendrogram berdasarkan urutan pengelompokan.

HASIL PENGAMATAN

A. Foto Hasil Pengamatan

Varians 1 Varians 2 Varians 3 Varians 4

B. Nilai Indeks kesamaan sifat yang diamati

No. Sifat yang Diamati (karakter)

Variasi Sifat ( Dalam spesies yang sama)

Individu / Varietas / Kultivar / Strain

1 2 3 4

1 Warna corak daun hijau-putih 1 0 0 1

2 Perbandingan panjang dan lebar daun 2 : 1

1 0 1 1

3 Warna tangkai daun putih 1 1 0 0

4 Permukaan daun bagian bawah bercorak

1 1 1 0

5 Daun muda mengkilat 1 0 1 0

6 Warna ibu tulang daun hijau 1 0 0 0

7 Perbandingan panjang tangkai daun dan panjang daun lebih dari 1/2

0 1 0 1

8 Tangkai daun bercorak 0 0 0 1

9 Permukaan daun muda licin 1 0 1 0

Jumlah Karakter 7 3 4 4* Tumbuhan yang Diamati : Aglaonema comutatum

2CA + B

C. Penghitungan Indeks Kesamaan

Jumlah karakter yang sama untuk :

Sp 1 – Sp 2 = 2

Sp 1 – Sp 3 = 4

Sp 1 – Sp 4 = 2

Sp 2 – Sp 3 = 1

Sp 2 – Sp 4 = 1

Sp 3 – Sp 4 = 1

Indeks Kesamaan Sorensen

S = x 100 %

S (Sp1 – Sp2) = [ (2*2) / (7+3) ] x 100% = 40 %

S (Sp1 – Sp3) = [ (2*4) / (7+4) ] x 100% = 72,7 %

S (Sp1 – Sp4) = [ (2*2) / (7+4) ] x 100% = 36,4 %

S (Sp2 – Sp3) = [ (2*1) / (3+4) ] x 100% = 28,6 %

S (Sp2 – Sp4) = [ (2*1) / (3+4) ] x 100% = 28,6 %

S (Sp3 – Sp4) = [ (2*1) / (4+4) ] x 100% = 25 %

Diagram Matriks 1

Sp 1 Sp 2 Sp 3 Sp 4

Sp 1 * 40 72,7 36,4

Sp 2 * 28,6 28,6

Sp 3 * 25

Sp 4 *

Indeks kesamaan tertinggi : (Sp1 – Sp3) = 73

Menghitung indeks kesamaan kelompok baru

I (Sp 1,Sp 3) (Sp 2) = [e (Sp 1,Sp2) + e (Sp 2,Sp 3)] / 2 = (40 + 28,6)/2 = 34,3

I (Sp 1,Sp 3) (Sp 4) = [e (Sp 1,Sp4) + e (Sp 3,Sp 4)] / 2 = (36,4 + 25)/2 = 30,7

Diagram matriks 2

(Sp 1,Sp 3) (Sp 2) (Sp 4)

(Sp 1, Sp 3) * 34,3 30,7

(Sp 2) * 29

(Sp 4) *

Indeks kesamaan tertinggi : (Sp 1,Sp 3) (Sp 2) = 34,3

Menghitung indeks kesamaan kelompok baru

I (Sp 1,Sp 3,Sp 2) (Sp 4) = [e (Sp 1,Sp4) + e (Sp 3,Sp 4)+ e (Sp 2,Sp 4)] / 3

= (36,4 + 25 + 28,6)/3 = 30

Diagram matriks 3

(Sp 1, Sp 3,Sp 2) (Sp 4)

(Sp 1, Sp 3,Sp 2) * 30

(Sp 4) *

Urutan pengelompokan

Sp 1, Sp 3 = 72,7

Sp 1, Sp 3, Sp 2 = 34,3

Sp 1, Sp 3, Sp 2, Sp 4 = 30

Dendogram

Dendogram Indeks kesamaan

1 3 2 4

100

90

80

70

60

50

40

30

20

10  

PEMBAHASAAN

Tabel dendogram menunjukan kedekatan kekerabatan dari suatu spesies, dalam

praktikum ini tumbuhan yang digunakan adalah tumbuhan Aglaonema comutatum. Semakin

besar angka kesamaan maka semakin tinggi kedekatan. Urutan sifat-sifat yang diamati

adalah:

Warna corak daun hijau-putih

Perbandingan panjang dan lebar daun 2 : 1

Warna tangkai daun putih

Permukaan daun bagian bawah bercorak

Daun muda mengkilat

Warna ibu tulang daun hijau

Perbandingan panjang tangkai daun dan panjang daun lebih dari ½

Tangkai daun bercorak

Permukaan daun muda licin

Dari sembilan karakteristik yang dibandingkan pada empat tipe Aglaonema comutatum,

yang digambarkan melalui diagram matriks 1 didapatkan indeks kesamaan yang paling tinggi

dari tipe Aglaonema comutatum ke 1 ( Sp1) dan tipe Aglaonema comutatum ke 3 ( Sp3)

yaitu sebesar 73. Sedangkan pada diagram matriks 2 indeks kesamaan terbesar diperoleh dari

(Sp 1,Sp 3) dan (Sp 2) yaitu sebesar 34,3 dan pada diagram matriks 3 diperoleh indeks

kesamaan (Sp 1,Sp 3,Sp 2) dan (Sp 4) sebesar 40. Dari ketiga diagram matriks tersebut

diperoleh data yang digunakan untuk membuat dendogram untuk menggambarkan hierarki

hubungan kekerabatan dari yang paling jauh dan yang paling dekat antara keempat tipe

Aglaonema comutatum yang dibandingkan kekerabatannya melalui sample 9 karakteristik

yang dibandingkan.

KESIMPULAN

Dari sembilan karakteristik yang dibandingkan pada empat tipe Aglaonema comutatum,

yang digambarkan melalui diagram matriks 1 didapatkan indeks kesamaan yang paling tinggi

dari tipe Aglaonema comutatum ke 1 ( Sp1) dan tipe Aglaonema comutatum ke 3 ( Sp3)

yaitu sebesar 73. Sedangkan pada diagram matriks 2 indeks kesamaan terbesar diperoleh dari

(Sp 1,Sp 3) dan (Sp 2) yaitu sebesar 34,3 dan pada diagram matriks 3 diperoleh indeks

kesamaan (Sp 1,Sp 3,Sp 2) dan (Sp 4) sebesar 40. Dari ketiga diagram matriks tersebut

diperoleh data yang digunakan untuk membuat dendogram untuk menggambarkan hierarki

hubungan kekerabatan dari yang paling jauh dan yang paling dekat antara keempat tipe

Aglaonema comutatum yang dibandingkan kekerabatannya melalui sample 9 karakteristik

yang dibandingkan.

DAFTAR PUSTAKA

F George, H George. 2005. Schaums Outline of Biology. 2 nd ed. Jakarta: Erlangga

Surya.2008. Genetika Strata 1. Yogyakarta: Gadjah Mada University Press