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大肠杆菌感受态细胞的制备、 重组 DNA 的转化、克隆筛选

Jan 21, 2016

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大肠杆菌感受态细胞的制备、 重组 DNA 的转化、克隆筛选. 1. 实验目的和要求 通过本实验学习氯化钙法制备大肠杆菌感受态细胞和外源质粒 DNA 转入受体菌细胞的技术以及筛选转化体的技术。了解细胞转化的概念及其在分子生物学研究中的意义。. 2. 相关知识及原理 感受态细胞 (Competent cells): 受体细胞经过一些特殊方法(如: CaCl , RuCl 等化学试剂法)的处理后,细胞膜的通透性发生变化,成为能容许多有外源 DNA 的载体分子通过的感受态细胞 (competent cell) 。. 转化( transformation ) : - PowerPoint PPT Presentation
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Page 1: 大肠杆菌感受态细胞的制备、 重组 DNA 的转化、克隆筛选

大肠杆菌感受态细胞的制备、

重组 DNA 的转化、克隆筛选

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1. 实验目的和要求通过本实验学习氯化钙法制备大肠杆菌感受态细胞和外源质粒 DNA 转入受体菌细胞的技术以及筛选转化体的技术。了解细胞转化的概念及其在分子生物学研究中的意义。

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2. 相关知识及原理

感受态细胞 (Competent cells):受体细胞经过一些特殊方法(如: CaCl ,RuCl 等化学试剂法)的处理后,细胞膜的通透性发生变化,成为能容许多有外源 DNA 的载体分子通过的感受态细胞 (competent cell) 。

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转化( transformation ):

是将异源 DNA 分子引入一细胞株系,使受体细胞获得新的遗传性状的一种手段,是基因工程等研究领域的基本实验技术。 进入细胞的 DNA 分子通过复制表达,才能实现遗传信息的转移,使受体细胞出现新的遗传性状。转化过程所用的受体细胞一般是限制-修饰系统缺陷的变异株,即不含限制性内切酶和甲基化酶的突变株。

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转化的方法:

1. 化学的方法 ( 热击法 ) ;使用化学试剂(如 CaCl )制备的感受态细胞,通过热击处理将载体 DNA 分子导入受体细胞;

2. 电转化法:使用低盐缓冲液或水洗制备的感受态细胞,通过高压脉冲的作用将载体DNA 分子导入受体细胞。

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克隆的筛选:

主要用不同抗生素基因筛选。常用的抗生素有:氨苄青霉素、卡那霉素、氯霉素、四环素、链霉素等;

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将经过转化后的细胞在选择性培养基中培养,才能较容易地筛选出转化体,即带有异源 DNA 分子的受体细胞。否则,如果将转化后的菌液涂在无选择性抗生素的培养基平板上,会出现成千上万的细菌菌落,将难以确认哪一个克隆含有转化的质粒。虽然只有那些含有被转化质粒的细菌才能在含有抗生素的平板上生长和繁殖,但对于连接混合物而言,此时并不能确定哪个克隆含有插入片段。

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重组质粒克隆的鉴定

鉴定带有重组质粒克隆的方法常用的有 -互补、小规模制备质粒 DNA 进行酶切分析、插入失活、 PCR 以及杂交筛选的方法。最常用的方法是小规模制备质粒 DNA 进行酶切分析,对于带有 LacZ 基因的载体还可以结合 - 互补现象来筛选。

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- 互补现象:

因为许多载体都带有一个 LacZ 基因的调控序列和头 146 个氨基酸的编码信息,编码 -互补肽,该肽段能与宿主编码的缺陷型 - 半乳糖苷酶实现基因内互补( - 互补)。当这种载体转入可编码-半乳糖苷酶 C端部分序列的宿主细胞中时,在异丙基 --D 硫代半乳糖苷( IPTG)的诱导下,宿主可同时合成这两种肽段,虽然它们各自都没有酶活性,但它们可以融为一体形成具有酶活性的蛋白质。所以称这种现象为 -互补现象。

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由互补产生的-半乳糖苷酶 (LacZ)能够作用于生色底物 5-溴- 4 -氯- 3-吲哚-- D-半乳糖苷 (X-gal)而产生蓝色的菌落,所以利用这个特点,在载体的该基因编码序列之间人工放入一个多克隆位点,当插入一个外源 DNA片段时,会造成 LacZ()基因的失活,破坏 - 互补作用,就不能产生具有活性的酶。所以,有重组质粒的菌落为白色,而没有重组质粒的菌落为蓝色。

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重组DNA转化细菌过程示意图

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3.仪器、材料和试剂无菌超净台,电热恒温水浴,分光光度计,离心机,移液器,微型离心管等;菌株: E.coli DH5α质粒: pBluscript KS+DNA 片段的质粒以及 pBluscript KS 空质粒;LB培养基;含抗菌素的 LB平板培养基(氨苄青霉素,浓度 50-100µg / mL , X-gal 20-48µg/ml, IPTG 100 µg/ml。一般将抗生素、 X-gal和 IPTG 配制成 1000储备液,用时按培养基的量再加入);预冷CaCl2溶液( 0.1mol / L )

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4.操作步骤 1 )大肠杆菌感受态细胞的制备 (CaCl2 法 )

( 1 )从新活化的 E.coli DH5α 菌平板上挑取一单菌落,接种于 3~ 5ml LB 液体培养中,37℃振荡培养 12h左右,直至对数生长期。将该菌悬液以 1:100~ 1:50 转接于 100ml LB

液体培养基中, 37℃振荡扩大培养,当培养液开始出现混浊后,每隔 20~ 30min测一次OD600nm ,至 OD600nm≤0.5 时停止培养;

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( 2 )每组取培养液 3 个 2ml 转入 2ml离心管中,在冰上冷却 20-30min ,于 4℃ ,4000r/ min离心 10min (从这一步开始,所有操作均在冰上进行,速度尽量快而稳);

( 3 )倒净上清培养液,用 1ml冰冷的 0.1mo1 / L CaCl2 溶液轻轻悬浮细胞,冰浴;

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( 4 ) 0~ 4℃, 4000r/min离心 10min ;

( 5 )弃去上清液,加入 500µl冰冷的 0.1mo1/ L CaCl2溶液,小心悬浮细胞。 0~ 4℃,4000r/min离心 10min ;

( 6 )弃去上清液,加入 100µl冰冷的 0.1mo1/ L CaCl2溶液,小心悬浮细胞,冰上放置片刻后,即制成了感受态细胞悬液;

( 7 )制备好的感受态细胞悬液可直接用于转化实验,也可加入占总体积 15%左右高压灭菌过的甘油,混匀后分装于 1.5ml离心管中,置于 -70℃条件下,可保存半年至一年。

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2 )细胞转化

(1) 分别取 3 个 100µl 感受态细胞悬液 ( 如是冷冻保存液,则需化冻后马上进行下面的操作 ) ,第一组,加入 10 µl 重组质粒 D

NA( 体积不超过 10µl)+ 100µl 感受态细胞,此管为转化实验组。第二组,插入 DNA 片段对照组,即酶切后 DNA 片段 25ng+100µl

感受态细胞悬液;第三组,质粒 DNA 对照组,即 1ng 未酶切 pBluescript 质粒 DNA

十 100µl 感受态细胞悬液。

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(2) 将以上各样品轻轻摇匀,冰上放置 20-30

min ,于 42℃水浴中保温 1 - 2min ,然后迅速冰上冷却 2min

(3) 立即向上述管中分别加入 0.4ml LB 液体培养基(不需在冰上操作),使总体积到 0.

5ml ,该溶液称为转化反应原液,摇匀后于37℃振荡培养约 45-60min ,使受体菌恢复正常生长状态,并使转化体表达抗生素基因产物 (Ampr) 。

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3) 平板培养(有时需要稀释)

(1)取各样品培养液 0.1ml ,分别接种于含抗菌素 LB 平板培养基上,涂匀(如果用玻璃棒涂抹,酒精灯烧过后稍微凉一下再用,不要过烫)。

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(2) 菌液完全被培养基吸收后,倒置培养皿,于 37℃恒温培养箱内培养过夜 (12-16 小时 ) ,待菌落生长良好而又未互相重叠时停止培养,对于可以蓝白斑筛选的质粒和菌株来说,此时应该能清楚地看到蓝色和白色菌落。

用 CaCl2 法制备的感受态细胞,可使每微克超螺旋质粒 DNA产生 5106-2107 个转化菌落。在实际工作中,每微克有 105 以上的转化菌落足以满足一般的克隆实验。

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4) 检出转化体和计算转化率统计每个培养皿中的菌落数,各实验组培养皿内菌落生长状况应如表所示 :

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组组 含抗菌素的平板含抗菌素的平板 结果说明结果说明

转化实验组 转化实验组 白色白色菌落和少量菌落和少量蓝色菌落蓝色菌落

说明有重组质粒导入说明有重组质粒导入细细胞中(有时还需要酶切胞中(有时还需要酶切进一步鉴定〕进一步鉴定〕

插入插入 DNADNA 片片段对照组段对照组

无菌落或极少量无菌落或极少量白色菌落白色菌落

说明插入片段比较纯或说明插入片段比较纯或有少量模板有少量模板 DANDAN存在存在

质粒对照组 质粒对照组 蓝色菌落蓝色菌落 可以判断感受态细胞的可以判断感受态细胞的效率效率

各实验组在培养皿内菌落生长状况及结果分析

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转化体总数=菌落数×(转化反应原液总体积 /涂板菌液体积)

插入频率=蓝色菌落数 /白色菌落数

转化频率=转化体总数 / 加入质粒 DNA的量(计算出每微克的转化菌落数)