Относно превода от руски - сложността на текста идва от това, че е научен труд в насока генетика - неточност в превода на термини и неясноти в смисъла на цели изречения е допустим. Автореферат към дисертационен труд на Ольги Рябининои (Олга Рябинина) Филогенетични връзки и генетично разнообразие на някои местни (отечествени) породи кучета (Според анализа на митохондрийната ДНК) Автореферат към дисертационен труд за степен – кандидат на биологичните науки Москва – 2008г. Работата е извършена в лаборатории по сравнителна генетика при животните Институт по обща генетика Н.И. Вавилова към РАН(Российская академия наук – Руска академия на науките) Научен ръководител: Член – кореспондент към РАН, проф. Захаров – Гезехус Илья Артемьевич Официални рецензии: Д-р. на биологическите науки Холодова Марина Владимировна Кандидат на биологическите науки Рычков Сергей Юрьевич С десертационния труд, може да се запознаете в библиотеката към Института по обща генетика Н.И. Вавилова към РАН Научен секратариат Дисертационене съвет: Кандидат на биологическите науки Полухина Г.Н. Извинявам се за липсата на фигурите и таблиците, ще се опитаме да поправим ситуацията в скоро време. Обща характеристика на работата
16
Embed
Автореферат към дисертационен труд на Ольги Рябининой (Олга Рябинина)
Автореферат към дисертационен труд на Ольги Рябининой (Олга Рябинина)
Welcome message from author
This document is posted to help you gain knowledge. Please leave a comment to let me know what you think about it! Share it to your friends and learn new things together.
Transcript
Относно превода от руски - сложността на текста идва от това, че е научен труд в насока генетика -
неточност в превода на термини и неясноти в смисъла на цели изречения е допустим.
Автореферат към дисертационен труд
на Ольги Рябининои (Олга Рябинина)
Филогенетични връзки и генетично разнообразие на някои местни (отечествени) породи кучета
(Според анализа на митохондрийната ДНК)
Автореферат към дисертационен труд за степен – кандидат на биологичните науки
Москва – 2008г.
Работата е извършена в лаборатории по сравнителна генетика при животните
Институт по обща генетика Н.И. Вавилова към РАН(Российская академия наук – Руска академия на
науките)
Научен ръководител:
Член – кореспондент към РАН, проф. Захаров – Гезехус Илья Артемьевич
Официални рецензии:
Д-р. на биологическите науки
Холодова Марина Владимировна
Кандидат на биологическите науки
Рычков Сергей Юрьевич
С десертационния труд, може да се запознаете в библиотеката към Института по обща генетика
Н.И. Вавилова към РАН
Научен секратариат
Дисертационене съвет:
Кандидат на биологическите науки
Полухина Г.Н.
Извинявам се за липсата на фигурите и таблиците, ще се опитаме да поправим ситуацията в скоро
време.
Обща характеристика на работата
Актуални теми. Произходът на домашните кучета, филогенетичните връзки на отделните породи,
също така и генетичното разнообразие и структурата на породите представляват интерес за света
на научните изследвания. Данните получени от генетици, археолози и биолози са взаимно
допълващи се, и позволяват да бъде възстановена схемата на филогения при кучето.
Секвениране на генома (определяне на първичната структура, последователност) на домашните
кучета за връзка на отделните породи и техните генетични структури, а така също и направлението
молекулярна медицина към хуманитарната медицина, използващи кучета като модели при
изучаването на наследствените заболявания, позволи процъвтяването на ветеринарната
медицина.
Изследванията на филогенетичните връзки при породите кучета се провеждат в цял свят, но в
Русия и бившите съветски републики, вкл. и евразийските; както и някои региони, разполажени на
пътя на човешките миграции - в близост до териториите, където се предполага , че е одомашено
кучето – остават почти неизследвани.
Един от най – широко използваните ДНК маркери във филогенетичните изследвания се явява този
на хипервариабилността на района, контролираната зона на митохондриалната ДНК. Този тип
маркер ни позволява да се проследи генофонда на животните по майчина линия, поради
снижената интензивност на рекомбинацията предавана по майчина линия.
Цели и задачи на изслседването. Изследване на филогенетичните връзки и генетичното
разнообразие на породите кучета, зародили се на териториите на Кавказ, Сибир и Централна
Азия.
Поставени са следните задачи:
1.Изследване на полиморфизма на нуклеотидните последователности на левия хипервариабилен
фрагмент от контролираната зона на митохондрийната ДНК у представителите на избраните
породи;
2.Сравнителен филогенетичен анализ на получените резултати за местните (отечествени) породи
кучета и публикуваните резултати от други автори отнасящи се за чужди породи;
3. Оценка на нивото на генетично разнообразие на местните породи кучета;
4 Въз основа на получените резултати от изследнването на митохондриалната ДНК, в съвкупност с
данните от кинолози, археолози, генетици и историци, се предполага възможност за
възстановяване на схемата на образуването на местните породи кучета.
Научни новости и практическа стойност на работата. В настоящата работа, за пръв път ще бъдат
изследвани филогенетичните взаимоотношения и нивото на генетично разнообразие по майчина
линия на аборигенните и заводски породи кучета (овчарски кучета от Северен Кавказ, лайки,
кавказка и средноазиатска овчарки) с използването в качеството на ДНК маркер,
последователността на фрагмента от контролната зона на митохондриалната ДНК.
Първо са проведени молекулярно – генетичните изследвания на кучетата от Северен Кавказ.
Получените резултати могат да бъдат използвани при изготвянето на програми за съхранение и
опазнване на породите кучета, за поддържане на необходимото ниво на генетично
разнообразие. В допълнение, резултатите могат да бъдат използвани в програми за опазване и
възстановяване на местните породи кучета, които са част от биологичното разнообразие на
страната.
Теоретическа значимост на работата. Свързана е с установяването на филогенетичните връзки на
отделните породи кучета и идентификация на техните корелациите за произход с историята и
филогенията на народите, населяващи регионите, в които са се зародили тези породи, изследвана
бива и филогенията и на други домашни животни от същите региони.
Тестване на работата. Основните резултати от дисертацията са представени на конференциите:
Международна конференция „Изчислителна филогенетика и геносистематика” (Москава, 2007г.)
Международна конференция „Биоинформатика и регулиране на генома”
(Новосибирск, 2006г.)
Международна конференция „Молегулно – генетични основи за съхранение на
биоразнообразието на бозайниците”
(Черноголовка, 2007г.)
Международна конференция „Генетика в Русия и Света” посветена на 40 – годишнината на
„Институт по обща генетика - Н.И. Вавилова” РАН (Москава, 2006г.)
6 – та Международна научна конференция „Съвременни постижения и проблеми на
биотехнологиите при селскостопанските животни” (Дубровици, 2007г.)
10 – та Конференция на младите учени при Пущинско училище – посветена на 50 – годишнината
на „Пущински научен център” към РАН (Пущино, 2006г.)
„3 – та Международна конференция на руско – иранското селско стопанство и ресурси” (Москва,
2002г.)
Публикации. По материали на дисертацията са публикувани 8 печатни работи.
Обем и структура на дисертацията. Дисертацията е изложена на 117 страници и съдържа следните
раздели: въведение, преглед на литературата, материали и методи, резултати и обсъждане,
изводи, библиография( включително 44 местни и 169 чужди източници) и приложения. Работата
съдържа 16 таблици и 13 фигури( без приложенията), приложенията се състоят от 3 таблици и 4
фигури(илюстрации).
Съдържание на работните материали. Като източник на ДНК са използвани проби от козина с
изтръгната луковицата на самия косъм, взети от различни кинологически мероприятия, както и
кръвни проби от кучета взети при рутинна ветиринарна практика.
Космените образци и кръвни проби са взети от представителите на: средноазиатска овчарка;
местни кучета от породната група на северно – кавказките вълкодави – населяващи Северна
Осетия и Караево – Черкезкия район; представители на заводските кавказки овчарки; руско –
европейски, западносибирски и източносибирски лайки; така също и от немски овчарски кучета.
За сравнителен анализ на получените генетични резултати са използвани по – ранни публикации
на други автори(Vila et al., 1997, Savolainen et al., 2002, van Asсh et al., 2005), за последователността
на хаплотиповият фрагмент на митохондрийната ДНК в чуждестранни кучета и лайки.
Получените в това проучване последователности на фрагмента на митохондрийната ДНК, както и
последователности от GenBank, за анализ са обединени в групи въз основа на морфологичния тип,
характера на традиционното им използване както и региона на разпространение.
(Таблица 1.) Съдържа - обща характеристика на групите създадени за анализ, както и
регистрационнния номер в базата данни на GenBank; хаплотиповия фрагмент на митохондрийната
ДНК при кучетата, описан от по – ранни автори (Savolainen et al., 2002).
Методи. Докладът анализира основните поредици на фрагмента на левия хипервариабилен
участък на митохондрийната ДНК от контролирания регион. Като матрица на PCR – амплификации,
за анализиране на частта на митохондрийната ДНК е използвана ДНК извлечена от космените
образци и кръвни проби. Последователностите получени на PCR – продуктът извършени по
модифицирания метод на Сангър с флуоресцентно откриване на капилярен генетичен анализатор
ABI-Prism 3100-Avant (Applied Biosystems, USA).
Определяне в получените първичните последователности, съответстващи на контролираната зона
на митохондрийната ДНК, проведено с изравняване със стандарта пълна последователност на
митохондрийна ДНК на куче.(GenBank accession number NC_002008)
Търсеният хиплотипов, идентичен, последователен фрагмент на митохондрийната ДНК от нас е
регистриран в GenBank, изследването е осъществено с помощта на програмата BLAST( уеб сървър
NCBI, адрес http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST )
Изолирането на хаплотипа сред получените първични последователности на митохондрийната
ДНК, изчисляване на параметрите на генетичното разнообразие, генетични разстояния, а така
също и йерархичен дисперсионен анализ (AMOVA) проведен с помощта на програмата Аrlequin
v.3.0 (Excoffier et al., 2005). Изградени са мрежи(таблици) с помощта на програмата TCS v.1.21
(Clement et al., 2002). Първо са описани хаплотипи, принадлежащи към изброените по – рано
хаплотипни групи - A, B, C, D, E (Savolainen et al., 2002), определени по средното групово
разстояние, вземайки под предвид модела на Тамуры-Нея (Тамур – Ней) както и относно
положението в изградената вече мрежа. Филогенетическите дървета са изградени по метода
(neighbor-joining) в програма Mega v.2.1 (Kumar et al., 2001,) и по метод UPGMA в програма Phylip
3.65 (Felsenstein, 2004).
Факторният анализ е на сдвоените FST (Fixation index), за генетичното разстояние (модел Тамуры-
Нея) проведен в програмата Статистика 6.0 (StatSoft, 2001).
Анализът на получените нуклеотидни последователности проведен по фрагментният размер 321
базисни пункта, се отнася до позиции 15459-15779 в пълната последователност на
митохондрийната ДНК при кучетата (GenBank accession number NC_002008). Първо са описани
хаплотипите рагистрирани в GenBank под номера: DQ403817, DQ403818, DQ403819, DQ403820,