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TAXONOMÍA
CIENCIA DE LA CLASIFICACIÓN DE LOS SERES VIVOS
IDENTIFICACIÓNIDENTIFICACIÓN NOMENCLATURANOMENCLATURA
TIPOS DE CLASIFICACIÓN
HEBERT COPELAND (1939 )
ALGAS VERDEAZULES(Archeophyta),
BACTERIASSchizophyta CyanobacteriaEsquizófitos ( )
TIPOS DE CLASIFICACIÓN
CARL WOESE (1970)Haeckel(1866)
Tres reinos
Chatton(1920)
Dos grupos
Copeland(1938,56)
Cuatro reinos
Whittaker(1969)
Cinco reinos
Woese(1977,90)
Tres dominios
Animalia Animalia AnimaliaPlantae Plantae
FungiProtista
Protista
ArchaeaProkaryota Monera Monera
Bacteria
Protista
Plantae EukaryaEucaryota
Estructura, composición y genética molecular
TAXONOMIA BACTERIANA CLÁSICA
Elementos considerados para la agrupación de microorganismos en escala taxonómica :
MorfologíaForma
Tamaño
Tinción de Gram
Movilidad
TAXONOMIA BACTERIANA CLÁSICA
Elementos considerados para la agrupación de microorganismos en escala taxonómica :
Nutrición y FisiologíaMecanismos de conservación de la energía
Fototrofos
Quimiorganotrofos
Quimiolitotrofos
Relación con el oxígeno y la temperatura
Tolerancia a la sal
Capacidad de utilizar varias fuentes de C, N y S
TAXONOMIA BACTERIANA CLÁSICA
Elementos considerados para la agrupación de microorganismos en escala taxonómica :
Otros factores
Pigmentos
Patogenicidad
Sensibilidad a los antibióticos
Identificación de microorganismos de manera clásica
General
Particular
Aislamiento de una bacteria del intestino de un animal homeotermo
Obtención del un cultivo puro
Tinción de Gram
Gram negativo
Forma de bastón
Facultativo
Fermentación lactosa, con producción de ácidos y gas
Pruebas bioquímicas, Positivas: indol, rojo de metilo
Negativas: citrato, Voges-Proskauer y H2S
Escherichia coli
TAXONOMÍA MOLECULAR
Contenido de GC
Contenido de guanina y citosina en el ADN genómicode un microorganismo.
Determinar el contenido de GC por:
•Temperatura de fusión
•Transferencia Southern
•Métodos cromatográficos
La introducción de otras técnicas
Temperatura De Fusión
• La unión de las cadenas de DNA se da por puentes de hidrógeno.
• El número de estos enlaces depende de los pares de bases.
• Cada par AT tiene 2 enlaces.
• Cada par CG tiene 3 enlaces.
Transferencia Southern
Hibridación de una cadena sencilla de ADN o de RNA con fragmentos de ADN inmobilizado en un filtro.
Cromatografía
Es una técnica de separación, aislamiento, cuantificación e identificación de los componentes de una mezcla de sustancias químicas.
TAXONOMÍA MOLECULARNacieron con el mejoramiento de las técnicas
moleculares
Es llamada también quimiotaxonomía
Emplea diferentes biomoléculas
Los principales métodos quimiotaxonomicos:
hibridación DNA:DNA
Ribotipado
Análisis de lípidos
HIBRIDACION DNA:DNA
La hibridación es la formación natural o construcción artificial de una molécula de ácido nucleico dúplex por apareamiento de bases complementarias entre dos cadenas de ácido nucleico procedentes de distintas fuentes.
Aislamiento de ADN y marcaje
RIBOTIPADO
Técnica de identificación bacteriana, en donde no se consideran las secuencias.
Uso de enzimas de restricción.
Revelación con sondas de RNA ribosómico.
ANALISIS DE ACIDOS GRASOS(FAME)
Técnica que consiste en la caracterización y
proporciones de los ácidos grasos presentes en los
lípidos de la membrana citoplasmática y de la
membrana externa de la pared celular.
¿Qué es especie?
En el mundo de los animales y plantas …
Población de individuos que puede entrecruzarse en
condiciones naturales, produciendo descendencia
fértil, y que esta aislada reproductivamente de otras
poblaciones.
¿Qué es especie?
En el mundo de los procariotas…
Es la colección de cepas estrechamente
relacionadas (>97% de homología en las secuencias
de rRNA 16s), pero lo bastante distintas de las otras
cepas como para ser reconocidas como una unidad
diferente.
¿Qué es especie?Secuencias de rRNA 16s que presenten una identidad menor al 97% hibridan en general menos del 70% (valor mínimo para considerar 2 organismos que pertenecen a la misma especie)
Género
Grupo taxonómico de especies relacionadas
Lo conforman el grupo de especies.
Se considera un nuevo género cuando
exista de un 93 a 95% de identidad en las
secuencias de RNA.
NOMENCLATURA
Rama de la taxonomía que se ocupa de la asignación de nombres a grupos taxonómicos de conformidad con normas publicadas
Al igual que en biología, se sigue el sistema binomial.
Los nombres se derivan del latín y se deben escribir con letras itálicas.
NOMENCLATURA
El nombre del grupo taxonómico entre el orden y el género se forma añadiendo el sufijo correspondiente a la raíz del nombre del género tipo.
Grupo taxonómico Sufijo EjemploOrden -ALES PseudomonadalesFamilia -ACEAE PseudomonadaceaeGénero Pseudomonas
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