Le reti Regionali: L’esperienza pugliese di BioBOP A.Paradiso Istituto Tumori, IRCCS, Bari.

Le reti Regionali:L’esperienza pugliese di BioBOP

A.ParadisoIstituto Tumori, IRCCS, Bari

L’INTERVENTO “RETI DI LABORATORI PUBBLICI DI RICERCA-Regione Puglia”

Accordo di Programma Quadro per la Ricerca (Delibera CIPE 35/2005 relativa alle risorse FAS per il periodo 2005 – 2008)

Le linee d'intervento per il rafforzamento del sistema regionale dell'innovazione sono:

• Sostegno alle attività di sviluppo sperimentale e all'innovazione di processo e organizzativa delle PMI e aiuti alla nascita e sviluppo di piccole imprese innovative

• Rafforzamento del potenziale tecnologico e infrastrutturale della Regione

• Diagnostici: nuovi Biomarkers

• Biomedicale tecnologie innovative

• Farmacologico validazione clinico-analitica di targets

• Campioni biologici umani

• Informazione su aggressività clinica

• Caratterizzazione biologica

• Procedure ELSI standardizzate

Medicina stratificata >>>>> personalizzata>>>>>precision

Lifecycle of a Biospecimen

Pre-acquisition Post Acquisition

AntibioticsOther drugsType of anesthesiaAnesthesia duration Arterial clamp time

Study DesignSOP’sEquipment Cohort DefinitionSOP’sMaterial TransferEthics

Courtesy Peter Riegman Erasmus University and Marble Arch International Working Group on Human Specimen Biobanking for Biomedical Research

Measure in Years

Pre- Release

Measure in Minutes

Storage MediaStorage MethodStorage TemperatureQuality ControlsPathology ReviewDisease SiteClinical DataData StandardsSOP’s

Acquisition

Processing TimeTemperatureFixation AgentSOP’s

Donor

Consent

Transport Receiving Storage

ScientificAnalysis

Medical/Surgical

Procedures

Restocking/Destruction

Release,DistributionTransport

Annotation

ProcessingQuality

Clinical BiobankingMedical Treatment

Medical Research

Unità di ricerca Responsabile

1: Istituto Tumori G Paolo II, IRCCS,Bari Dr A Paradiso2: Dip Scienze Mediche e Lavoro, Univ Foggia Prof A Liso3: Dip Fisiol Generale e Ambientale, Univ Bari Prof S Reshkin4: Ist. Tecnologie Biomediche, CNR, Bari Prof G Pesole5: Dip Fisiol Generale e Ambientale, Univ. Bari Prof S Cotecchia6: IRCCS CSS, S. Giovanni Rotondo Prof V Fazio

Biobanca Regionale DataBase

Uni FG- Ematologie CSS SGR

UniBa

ITBCNR

IRCCS Tumori

Bari

BioBOP

Tessuti UmaniCaratterizzzazione Biologica

Realtà Produttiva

UO2: Dip Scienze Mediche e Lavoro, Fac. Medicina e Chirurgia, Univ FoggiaProf Arcangelo Liso

AutoMACS Pro Separator, Miltenyi

Dip. Bioscienze, Biotecnologie e Biofarmaceutica Università Bari Prof S ReshkinProf S Cotecchia

Microscopio confocale

Laser multi-fotoni

Targa del Confocale: BioBoP/Università

Targa del multi-fotoni: BioBoP/Università

4. Contatore automatico di cellule:

1.

2

1. Liquid Handler:

2. Digital PCR:

3. Sistema di frammentazione a ultrasuoni:

3

4

UO4: Ist. Tecnologie Biomediche, CNR, BariProf Graziano PesoleDr. Apollonia TulloDr. Apollonia Tullo

UO6: IRCCS Casa Sollievo Sofferenza, S. Giovanni RotondoProf V FazioDr P Parrella

HT7900 Fast Real time PCR System (Life Technology). Sistema di PCR in Real Time dotato di blocco Low Density Array (LDA) che permette di analizzare fino a 380 diversi target precedentemente depositati su una apposita card. Conferendo allo strumento funzionalità di microarray a bassa densità.

Uni FG- Ematologie CSS SGR

UniBa

ITBCNR

IRCCS Tumori

Bari

BioBOP

Tessuti UmaniCaratterizzzazione Biologica Realtà Produttiva

Biobanca Istituto Tumori Bari

Biobanca Oncologica: il percorso dell’Istituto Tumori, IRCCS, Bari• Struttura

• Biobanking dal 1988 Lab Recettori Ormonali e Cinetica Cellulare• Biobanca Laboratorio Oncologia Sperimentale>> Certificazione ISO 9001 nel

2008• Biobanca Istituzionale 2009• Biobanca di interesse Regionale-BioBOP 2011

• Responsabilità• 2004: Italian Network Cancer Biobanks (NICAB): coordinamento• 2008: Rete Italiana Biobanche Oncologiche (RIBBO): coordinamento• 2009: EORTC Biobank WG co-chairman• 2010: BBMRI Prototype Project, chairman Italian Cancer Biobanks• 2012: BBMRI-ESFRI: member DG Committee

• Pubblicazioni>100• Special Issue Biopreservation&Biobanking, vol 9, n.2, 2011

(Guest Edt Paradiso A, Daidone MG, Riegman P)

Biobanca Istituto Tumori Bari:Le esigenze

Dimensioni:Storage Biocampioni per Istituto Tumori

Riferimento RegionalePerformancesVersatilità Different tissues

Biomolecular Resource Centre• Storage material of GMP Facility

Ingresson. 2 livelli, 280 mq

Livello 2:Area Stocckaggio per Diagnostica/ricerca Criocontenitori, -80°C, -143°C,-173°CArea Stocckaggio Materiale terapeutico Criocontenitori,-143°C,-173°C, discesa

Livello 1: Elaborazione datiLaboratorio manipolazione, aliquotaggioLaboratorio Produzione Derivati

BioBanca IstituzionaleArea Congelatori piano -1

1)Equipment Monitoring, Calibration, Maintenance, and Repair2)Control of Biospecimen Collection Supplies3)Biospecimen Quality Control Testing4) Biosafety (Grizzle and Fredenburgh 2001)

Specimen traceability: The Tissue Bank Project

BioBanca IstituzionaleIRCCS Bari

Storage

CERTIFIC

AZIONE

Clinical Pathology

Biobanche tra presente e futuro Organizzazione-Gestione

Standard Operating Procedures I

• Informed Consent.

• Equipment Monitoring, Calibration, Maintenance, and Repair • Control of Biospecimen Collection Supplies (Disposables and Reagents)• Biospecimen Identification and Labeling • Biospecimen Collection and Processing Methods• Storage and Retrieval• Shipping and Receiving• In-House Including Biospecimen Quality Control Testing

• Biospecimen Data Collection and Management (Informatics)

• Biosafety

• Training

• Security

(OBBR-NCI, last Revision 2010)

BIOBANCA ISTITUZIONALE Istituto Tumori Bari

Opportunità:Governance: Management Interno

Rapporti con Providers-Rete BioBOP Rapporti con Stake-holders

Sostenibilità/costi Barbareschi M (Pathologica, 2008)D’Agnolo G (CNSBBV, RIBBO,

2012) Clement B (JTM, 2014)

Clement B,JTM 2014

Outputs for a Biobank

• Make research - Scientific publication (BRIF)(Hofman V, ..Parodi B, et al Biopreserv Biobank. 2013;

• Utilization of biobank resources (underuse)(Paradiso A, Hansson M, Nature Medicine, 2013)

BIOBANCA ISTITUZIONALE Istituto Tumori Bari

Punti di forza:Capacità di sostenere l’impresa (Call “Clusters

tecnologici”)

Sviluppare Ricerca (ONEV, Trials Clinici, BBMRI, Registro Tumori )

Cultura/Regolamentazione Biobanking a Livello Regionale

Accordo Conferenza permanente Stato-Regioni 25 Marzo 2009“Regioni responsabili della individuazione/regolamentazione delle

biobanche da certificare nel territorio di competenza”

• Rete biobanche Regione Liguria (delibera n.34 Giunta Regionale , 22 gennaio 2010)

• Rete biobanche Regione Campania (delibera n.39 Giunta Regionale 14 febbraio 2011)

• Rete Oncologica Lombarda (ROL) (Decreto n.10507,Novembre 2012. Linee Guida Regolamentazione Biobanche di Ricerca )

• Regione Toscana (delibera n.974 del 25 novembre 2013)

http://www.bbmri.it/regioni

Biobanca: sito web www.biobop.itEmail: bancatessuti.oncologia@oncologico.bari.it

Coord Scient. A Paradiso a.paradiso@oncologico.bari.it

RUP GSalomone g.salomone@oncologico.bari.it

BBMRI.IT ML Lavitrano www.bbmri.it