Молекулярная эволюция рода Tribolodon (Teleostei: Cyprinidae)
Семина А.В.лаборатория генетики
ИБМ ДВО РАН
T. hakonensisT. brandti
T. nakamuraiT. sakhalinensis
Сахалин
Приморскийкрай
Хабаровский край
Тумнин
ЧибисонБахураФирсовка
СусуяКорсаковка
Лютога
Тат
арск
ий п
роли
в
Японс
кое м
оре
ХоккайдоСеверо-западТихого океана
Охотское море
Залив Петра Великого
о. Хонсю
Набильский залив
Tribolodon brandtiTribolodon nakamuraiTribolodon sakhalinensisTribolodon hakonensisPseudoaspius leptocephalusLeuciscus waleskii
Положение четырех исследованных ПЦР-сегментов относительно линейной генной карты митохондриальной
ДНК позвоночных
•ND3/ND4/ND4L/ND5/ND6•A6/A8•COIII•12S/16S
Consensus maximum parsimony tree
Numbers above – bootstrap valuesnreps=1000
Leuciscus waleskiiPseudoaspius leptocephalusTribolodon sakhalinensisT. hakonensis южный типT. hakonensis северный типT. nakamuraiT. brandti
C1C2G1N1M1M13M2M9M18M8E1E2E4K1K3K2S1S2S3S16S9
100
100
100
78
78
100
100
100
100
100
C1C3C4C5C6C7C2 G1 N1 M1M5M15M16M3M13M14M17M8M2M4M6M7M9M10M11M12M18M19M20E1E12E16E14E17E20E2E6E11E3E4E15E19E5E7E8E9E10E13E18 K1K10K16K2K6K7K9K11K12K13K20K3K4K5K8K14K15K17K18K19 S1S4S2S5S8S10S11S13S14S15S18S9S3S6S12S16S17S19S20S70.1
Leuciscus waleskii
99
98
98
98
99
98
Pseudoaspius leptocephalusT. nakamurai
T. sakhalinensis
T. brandti
T. hakonensis южный тип
T. hakonensis северный тип
Bayesian analysis
Numbers above – posterior probability
Скорость молекулярной эволюции, полученная с помощью калибровки палеонтологических и молекулярных данных
Разброс значений дивергенции при попарном сравнении последовательностей ДНК с момента исходной дивергенции (млн. лет), рассчитанной на основе
появления в ископаемых находках диагностического апоморфного признака.0.66% за 1 млн. лет
2002
Campostoma ol igolepisCampostoma anomalumCouesius plumbeusP lagopterus argentissimusSemotilus atromaculatusLeuciscus w aleckiiPhoxinus lagow skiiPseudaspius leptocephalusTribolodon nakamuraiTribolodon hakonensisTribolodon ezoeTribolodon brandtiCyprinella spilopteraRhinichthys atratulusRhinichthys osculusNocomis biguttatusNocomis micropogon
Maximum parsimony treeна основе последовательностей
сyt b
Эволюционные взаимоотношения североамериканских карповых рыб и
и исследуемой группы видов
Maximum parsimony treeна основе последовательностей
сyt b
Dowling et al., 2002Эволюционные взаимоотношения
североамериканских карповых рыб
Четвертичныйпериод
Плейстоценовая
Голоценовая 0.01
1.6 1.6
Неогеновыйпериод
Палеогеновыйпериод
Плиоценовая
Миоценовая 23.7 18.4
3.7
Эоценовая
Палеоценовая
33.7 10.0
57.8 24.1
66.4
5.3
8.6
-
Период Эпоха Началомлн. лет
Продолж.млн. лет
Олигоценовая Дивергенция L. waleskii vs. Tribolodon
и P. leptocephalus~20 млн. лет
Ископаемые находки
Tribolodon sp.
Поздний Олигоцен
Дивергенция северной и южной форм T. hakonensis
~3.5 млн. летДивергенция T. nakamurai~8 млн. летПоздний
МиоценДивергенция T. hakonensis,
T. brandti, T. sakhalinensis и P. leptochephalus~14-15 млн. лет
СреднийМиоцен
р. Амур
р. Раздольная(Суйфун)
Речная система палео-Амура
Речная системапалео-Суйфуна
Северо-западТихого океана
о. Сахалин
о. Хоккайдо
Японс
кое м
оре
T. brandti
T. brandti
404
190
T. hakonensis южный тип
T. hakonensis южный тип
501
331242
147111
67
489
T. hakonensis северный тип
T. hakonensis северный тип
Фрагмент гена гормона роста
~1300 пн
Зонагибридизации
Фрагмент, кодирующий А6/А8/ND3, после обработки рестриктазой RsaI
М1 – 100 bp Ladder+1500 bp; M2 – λ/PstI
Рестрикционные спектры являются строго видоспецифичными и не перекрываются
Фенограмма, иллюстрирующая филогенетические отношения между северными и южными популяциями Tribolodon
hakonensis
Северный тип T. hakonensisЮжный тип T. hakonensis
Популяции:1. р. Фирсовка2. р. Ильинское3. р. Бахура4. р. Корсаковка5. р. Тумнин
6. р. Терней7. зал. Восток8. р. Раздольная
Кета – Oncorhynchus keta
Филогенетические отношения в популяциях кеты
Пиленгас
Лобан
Сингиль
Сем. Mugilidae
Филогенетические отношения кефалей Японского, Азовского и Средиземного морей
