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Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 Junk DNA Nicht-proteinogene DNA

Apr 05, 2015

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  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Junk DNA Nicht-proteinogene DNA
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  • Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org
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  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org gilt fr 2% der menschlichen DNA Rest ?
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  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Einfhrung Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 5
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Einfhrung Codierende DNA: Mensch 2% Mais1% A. thaliana70% Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 6
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Einfhrung Rest: Junk DNA Unntige DNA DNA ohne erkennbare Bedeutung Nicht-proteincodierende DNA ENCODE; RNome; Transkriptionseinheit Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 7
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Fragestellung Ist Junk-DNA berflssig? Woher kommt Junk-DNA? Was beinhaltet Junk-DNA? Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 8
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Fragestellung Indizien: Fehlende Korrelation: DNA-Menge Entwicklungsstufe Zahl der Gene Ungewollte Anhufung Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 9
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Fragestellung Mechanismen: Genduplikation Stillegung von Genkopien Transposons Retroviren Mangelnde Selektion Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 10
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Fragestellung Neue berlegung: 98% berflssig? Regulatoren und andere Elemente jenseits der Genebene? Komplexitt / Genanzahl? Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 11
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Erklrungsanstze Schtze in Junk-DNA Neue Erkenntnisse (und Spekulation) in verschiedenen Richtungen Keine allgemeine Methode Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 12
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 13
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Ribozyme -katalytisch aktiv -analoge Erkennung (wie Proteine) Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 14
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 15
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 16
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Antisense-RNA -regulatorisch aktiv -digitale Erkennung (Komplementrsequenz) -wirkt allein, simpler Mechanismus Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 17
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen Blockierung der mRNA durch Hybridisierung Antisense-RNA
  • Folie 18
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Mikro-RNA und RNAi -regulatorisch aktiv -digitale Erkennung (Komplementrsequenz) -komplexe Maschinerie Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 19
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen mikroRNA-Sequenzen im Intron (oder anderswo); hairpin nach der Transkription
  • Folie 20
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen Freisetzen durch Splicing Spaltung durch Dicer: aktive Fragmente (RNAi)
  • Folie 21
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen Erkennen der mRNA: Hybridisierung Abbau durch Enzymkomplex Andere Funktionen?
  • Folie 22
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Riboswitches -regulatorisch und katalytisch aktiv -analoge Erkennung (niedermolekulare Substanzen) Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 23
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen RNA beinhaltet: - Riboswitch-Abschnitt - proteincodierenden Abschnitt
  • Folie 24
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen RNA-Struktur verhindert Ablesen Aufhebung durch Signalstoffe
  • Folie 25
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Aktive RNA: Bewertung Bewertung -Schtzung Maus: 70000 Einheiten vs. 30000 Gene -Pseudogene Erforschung - Zufallsmutagenese (z.B. Maus) Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 26
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Volumenfunktion Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transposons LR-Enhancer Strukturfunktion Andere offene Fragen Schlussbetrachtung Referenzen
  • Folie 27
  • Junk DNA Nicht-proteinogene DNA Josef Riedl 06 / 2004 http://josef.riedl.org Volumenfunktion Keine Korrelation: DNA-Menge Genzahl Korrelation: DNA-Menge Kernvolumen DNA-Menge Zellvolumen (Th. Cavalier-Smith) Einfhrung Fragestellung Erklrungsanstze Aktive RNA: Ribozyme Digitale Erkennung Riboswitches Volumenfunktion Transp
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